Počet záznamů: 1
Repeated MDA5 Gene Loss in Birds: An Evolutionary Perspective
- 1.
SYSNO ASEP 0554930 Druh ASEP J - Článek v odborném periodiku Zařazení RIV J - Článek v odborném periodiku Poddruh J Článek ve WOS Název Repeated MDA5 Gene Loss in Birds: An Evolutionary Perspective Tvůrce(i) Krchlíková, Veronika (UMG-J)
Hron, Tomáš (UMG-J)
Těšický, M. (CZ)
Li, T. (CZ)
Hejnar, Jiří (UMG-J) RID
Vinkler, M. (CZ)
Elleder, Daniel (UMG-J) RIDCelkový počet autorů 7 Číslo článku 2131 Zdroj.dok. Viruses. - : MDPI
Roč. 13, č. 11 (2021)Poč.str. 12 s. Forma vydání Online - E Jazyk dok. eng - angličtina Země vyd. CH - Švýcarsko Klíč. slova avian genome ; viral sensors ; innate immunity ; gene loss Vědní obor RIV EB - Genetika a molekulární biologie Obor OECD Virology CEP GA20-22063S GA ČR - Grantová agentura ČR Způsob publikování Open access Institucionální podpora UMG-J - RVO:68378050 UT WOS 000725811500001 DOI 10.3390/v13112131 Anotace Two key cytosolic receptors belonging to the retinoic acid-inducible gene I (RIG-I)-like receptor (RLR) family sense the viral RNA-derived danger signals: RIG-I and melanoma differentiation-associated protein 5 (MDA5). Their activation establishes an antiviral state by downstream signaling that ultimately activates interferon-stimulated genes (ISGs). While in rare cases RIG-I gene loss has been detected in mammalian and avian species, most notably in the chicken, MDA5 pseudogenization has only been detected once in mammals. We have screened over a hundred publicly available avian genome sequences and describe an independent disruption of MDA5 in two unrelated avian lineages, the storks (Ciconiiformes) and the rallids (Gruiformes). The results of our RELAX analysis confirmed the absence of negative selection in the MDA5 pseudogene. In contrast to our prediction, we have shown, using multiple dN/dS-based approaches, that the MDA5 loss does not appear to have resulted in any compensatory evolution in the RIG-I gene, which may partially share its ligand-binding specificity. Together, our results indicate that the MDA5 pseudogenization may have important functional effects on immune responsiveness in these two avian clades. Pracoviště Ústav molekulární genetiky Kontakt Nikol Škňouřilová, nikol.sknourilova@img.cas.cz, Tel.: 241 063 217 Rok sběru 2022 Elektronická adresa https://www.mdpi.com/1999-4915/13/11/2131
Počet záznamů: 1