Počet záznamů: 1

PAIREF

SYSNO ASEP	0554216
Druh ASEP	L4 - Software
Zařazení RIV	R - Software
Název	PAIREF
Tvůrce(i)	Malý, Martin (BTO-N)_ORCID Diederichs, K. (DE) Dohnálek, Jan (BTO-N)_{RID, ORCID} Kolenko, Petr (BTO-N)_{ORCID, RID}
Rok vydání	2021
Int.kód	v1.2.8
Technické parametry	PAIREF is a Python-based program for the Computational Crystallography Toolbox available for Windows, GNU/Linux and MacOS. Graphical and command-line interfaces are provided. For structure model refinement, PAIREF supports REFMAC5 (part of the CCP4 Software Suite) and phenix.refine (part of the Phenix package). This work is co-developed with the Czech Technical University in Prague, Faculty of Nuclear Sciences and Physical Engineering, Břehová 7, Prague, IČ: 68407700
Ekonomické parametry	This project was funded by the MEYS CR (projects CAAS – CZ.02.1.01/0.0/0.0/16_019/0000778, BIOCEV – CZ.1.05/1.1.00/02.0109, and ELIBIO – CZ.02.1.01/0.0/0.0/15_003/0000447) from the ERDF fund, by the Czech science foundation (project 18-10687S), by the Czech Academy of Sciences (project 86652036), and by the GA CTU in Prague (SGS19/189/OHK4/3T/14). This work is co-developed with the Czech Technical University in Prague, Faculty of Nuclear Sciences and Physical Engineering, Břehová 7, Prague, IČ: 68407700
Název vlastníka	Institute of Biotechnology of the Czech Academy of Sciences
IČ vlastníka	86652036
Požad. na licenč. popl.	N - Poskytovatel licence nepožaduje licenční poplatek
Číselná identifikace	L4
Jazyk dok.	eng - angličtina
Země vlastníka	CZ - Česká republika
Klíč. slova	X-ray diffraction ; structure refinement ; data resolution
Vědní obor RIV	BO - Biofyzika
Obor OECD	Biochemistry and molecular biology
CEP	ED1.1.00/02.0109 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy
	EF15_003/0000447 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy
	GA18-10687S GA ČR - Grantová agentura ČR
Institucionální podpora	BTO-N - RVO:86652036
Anotace	PAIREF is a scientific program for macromolecular crystallography. It automatically estimates an optimal high-resolution cutoff, the important parameter of experimental diffraction data. The algorithm is based on the paired refinement protocol. Further details were published in the following manuscripts: M. Malý, K. Diederichs, J. Dohnálek, P. Kolenko: Paired refinement under the control of PAIREF (2020) IUCrJ 7, 681-692, M. Malý, K. Diederichs, J. Dohnálek, P. Kolenko: PAIREF: paired refinement also for Phenix users (2021) Acta Cryst. F77, 226-229.
Pracoviště	Biotechnologický ústav
Kontakt	Monika Kopřivová, Monika.Koprivova@ibt.cas.cz, Tel.: 325 873 700
Rok sběru	2022
Elektronická adresa	https://pairef.fjfi.cvut.cz/

Počet záznamů: 1