Počet záznamů: 1
Rotational Diffusion of Membrane Proteins in Crowded Membranes
- 1.
SYSNO ASEP 0524096 Druh ASEP J - Článek v odborném periodiku Zařazení RIV J - Článek v odborném periodiku Poddruh J Článek ve WOS Název Rotational Diffusion of Membrane Proteins in Crowded Membranes Tvůrce(i) Javanainen, Matti (UOCHB-X) RID, ORCID
Ollila, O. H. S. (FI)
Martinez-Seara, Hector (UOCHB-X) RID, ORCIDZdroj.dok. Journal of Physical Chemistry B. - : American Chemical Society - ISSN 1520-6106
Roč. 124, č. 15 (2020), s. 2994-3001Poč.str. 8 s. Jazyk dok. eng - angličtina Země vyd. US - Spojené státy americké Klíč. slova lipid membranes ; Brownian motion ; force field Vědní obor RIV CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie Obor OECD Physical chemistry CEP GX19-26854X GA ČR - Grantová agentura ČR Způsob publikování Omezený přístup Institucionální podpora UOCHB-X - RVO:61388963 UT WOS 000526368900003 EID SCOPUS 85083545186 DOI 10.1021/acs.jpcb.0c00884 Anotace Membrane proteins travel along cellular membranes and reorient themselves to form functional oligomers and proteinlipid complexes. Following the Saffman-Delbruck model, protein-radius sets the rate of this diffusive motion. However, it is unclear how this model, derived for ideal and dilute membranes, performs under crowded conditions of cellular membranes. Here, we study the rotational motion of membrane proteins using molecular dynamics simulations of coarse-grained membranes and 2-dimensional Lennard-Jones fluids with varying levels of crowding. We find that the Saffman-Delbruck model captures the size-dependency of rotational diffusion under dilute conditions where protein-protein interactions are negligible, whereas stronger scaling laws arise under crowding. Together with our recent work on lateral diffusion, our results reshape the description of protein dynamics in native membrane environments: The translational and rotational motions of proteins with small transmembrane domains are rapid, whereas larger proteins or protein complexes display substantially slower dynamics. Pracoviště Ústav organické chemie a biochemie Kontakt asep@uochb.cas.cz ; Kateřina Šperková, Tel.: 232 002 584 ; Viktorie Chládková, Tel.: 232 002 434 Rok sběru 2021 Elektronická adresa https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jpcb.0c00884
Počet záznamů: 1