Počet záznamů: 1  

An empirical comparison of popular structure learning algorithms with a view to gene network inference

  1. 1.
    SYSNO ASEP0477168
    Druh ASEPJ - Článek v odborném periodiku
    Zařazení RIVJ - Článek v odborném periodiku
    Poddruh JČlánek ve WOS
    NázevAn empirical comparison of popular structure learning algorithms with a view to gene network inference
    Tvůrce(i) Djordjilović, V. (IT)
    Chiogna, M. (IT)
    Vomlel, Jiří (UTIA-B) RID, ORCID
    Celkový počet autorů3
    Zdroj.dok.International Journal of Approximate Reasoning. - : Elsevier - ISSN 0888-613X
    Roč. 88, č. 1 (2017), s. 602-613
    Poč.str.14 s.
    Jazyk dok.eng - angličtina
    Země vyd.US - Spojené státy americké
    Klíč. slovaBayesian networks ; Structure learning ; Reverse engineering ; Gene networks
    Vědní obor RIVJD - Využití počítačů, robotika a její aplikace
    Obor OECDComputer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)
    CEPGA16-12010S GA ČR - Grantová agentura ČR
    Institucionální podporaUTIA-B - RVO:67985556
    UT WOS000407655600031
    EID SCOPUS85009223244
    DOI10.1016/j.ijar.2016.12.012
    AnotaceIn this work, we study the performance of different structure learning algorithms in the context of inferring gene networks from transcription data. We consider representatives of different structure learning approaches, some of which perform unrestricted searches, such as the PC algorithm and the Gobnilp method, and some of which introduce prior information on the structure, such as the K2 algorithm. Competing methods are evaluated both in terms of their predictive accuracy and their ability to reconstruct the true underlying network. Areal data application based on an experiment performed by the University of Padova is also considered.
    PracovištěÚstav teorie informace a automatizace
    KontaktMarkéta Votavová, votavova@utia.cas.cz, Tel.: 266 052 201.
    Rok sběru2018
Počet záznamů: 1  

  Tyto stránky využívají soubory cookies, které usnadňují jejich prohlížení. Další informace o tom jak používáme cookies.