Počet záznamů: 1
Epigenome-wide analysis of DNA methylation reveals a rectal cancer-specific epigenomic signature
- 1.
SYSNO ASEP 0469354 Druh ASEP J - Článek v odborném periodiku Zařazení RIV J - Článek v odborném periodiku Poddruh J Článek ve WOS Název Epigenome-wide analysis of DNA methylation reveals a rectal cancer-specific epigenomic signature Tvůrce(i) Vymetálková, Veronika (UEM-P) RID
Vodička, Pavel (UEM-P) RID
Pardini, Barbara (UEM-P)
Rosa, F. (IT)
Levý, M. (CZ)
Schneiderová, M. (CZ)
Liška, V. (CZ)
Vodičková, Ludmila (UEM-P) RID
Nilsson, T.K. (SE)
Farkas, S. A. (SE)Zdroj.dok. Epigenomics - ISSN 1750-1911
Roč. 8, č. 9 (2016), s. 1193-1207Poč.str. 21 s. Jazyk dok. eng - angličtina Země vyd. GB - Velká Británie Klíč. slova DNA methylation ; Illumina Human Methylation 450 BeadChip ; rectal cancer Vědní obor RIV EB - Genetika a molekulární biologie Obor OECD Biochemistry and molecular biology CEP NT13424 GA MZd - Ministerstvo zdravotnictví NV15-27580A GA MZd - Ministerstvo zdravotnictví GA15-08239S GA ČR - Grantová agentura ČR LD14050 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy Institucionální podpora UEM-P - RVO:68378041 UT WOS 000383180400005 EID SCOPUS 84986910214 DOI 10.2217/epi-2016-0044 Anotace Aim: The aim of the present study is to address a genome-wide search for novel methylation biomarkers in the rectal cancer (RC), as only scarce information on methylation profile is available. Materials & methods: We analyzed methylation status in 25 pairs of RC and adjacent healthy mucosa using the Illumina Human Methylation 450 BeadChip. Results: We found significantly aberrant methylation in 33 genes. After validation of our results by pyrosequencing, we found a good agreement with our findings. The BPIL3 and HBBP1 genes resulted hypomethylated in RC, whereas TIFPI2, ADHFE1, FLI1 and TLX1 were hypermethylated. An external validation by TCGA datasets confirmed the results. Conclusion: Our study, with external validation, has demonstrated the feasibility of using specific methylated DNA signatures for developing biomarkers in RC. Pracoviště Ústav experimentální medicíny Kontakt Lenka Koželská, lenka.kozelska@iem.cas.cz, Tel.: 241 062 218, 296 442 218 Rok sběru 2017
Počet záznamů: 1