Počet záznamů: 1
Fluorescence Quenching in Oligonucleotides Containing 7-Substituted 7-Deazaguanine Bases Prepared by the Nicking Enzyme Amplification Reaction
- 1.
SYSNO ASEP 0443634 Druh ASEP J - Článek v odborném periodiku Zařazení RIV J - Článek v odborném periodiku Poddruh J Článek ve WOS Název Fluorescence Quenching in Oligonucleotides Containing 7-Substituted 7-Deazaguanine Bases Prepared by the Nicking Enzyme Amplification Reaction Tvůrce(i) Ménová, Petra (UOCHB-X) RID
Dziuba, Dmytro (UOCHB-X)
Güixens-Gallardo, Pedro (UOCHB-X) RID, ORCID
Jurkiewicz, Piotr (UFCH-W) RID, ORCID
Hof, Martin (UFCH-W) RID, ORCID
Hocek, Michal (UOCHB-X) RID, ORCIDCelkový počet autorů 6 Zdroj.dok. Bioconjugate Chemistry. - : American Chemical Society - ISSN 1043-1802
Roč. 26, č. 2 (2015), s. 361-366Poč.str. 6 s. Jazyk dok. eng - angličtina Země vyd. US - Spojené státy americké Klíč. slova ethidium bromide ; electrochemical detection ; DNA Vědní obor RIV CC - Organická chemie Vědní obor RIV – spolupráce Ústav fyzikální chemie J.Heyrovského - Fyzikální chemie a teoretická chemie CEP GBP206/12/G151 GA ČR - Grantová agentura ČR Institucionální podpora UOCHB-X - RVO:61388963 ; UFCH-W - RVO:61388955 UT WOS 000349807200024 EID SCOPUS 84923247686 DOI 10.1021/acs.bioconjchem.5b00006 Anotace Recently, we reported the use of the Nicking Enzyme Amplification Reaction (NEAR) for the enzymatic synthesis of short oligonucleotides (ONs) containing 5-substituted pyrimidine or 7-substituted 7-deazaadenine nucleotides. Since no oligonucleotide products were visible on agarose gels stained by an intercalating dye (GelRed), we assumed that the method did not work for 7-substituted 7-deazaguanine deoxyribonucleoside triphosphates. We revisited the work and found that the NEAR method works for 7-deazaguanine nucleotides as well but that the resulting modified ONs quench the fluorescence of DNA intercalators, rendering them invisible on gel electrophoresis stained by them. Here, we report on the modified methodology for the NEAR synthesis and analysis of G-modified ONs and on quantification of the fluorescence quenching. Pracoviště Ústav organické chemie a biochemie Kontakt asep@uochb.cas.cz ; Kateřina Šperková, Tel.: 232 002 584 ; Viktorie Chládková, Tel.: 232 002 434 Rok sběru 2016
Počet záznamů: 1