Počet záznamů: 1
histoneHMM: Differential analysis of histone modifications with broad genomic footprints
- 1.
SYSNO ASEP 0443201 Druh ASEP J - Článek v odborném periodiku Zařazení RIV J - Článek v odborném periodiku Poddruh J Článek ve WOS Název histoneHMM: Differential analysis of histone modifications with broad genomic footprints Tvůrce(i) Heinig, M. (DE)
Colomé-Tatché, M. (NL)
Taudt, A. (NL)
Rintisch, C. (DE)
Schafer, S. (DE)
Pravenec, Michal (FGU-C) RID, ORCID
Hubner, N. (DE)
Vingron, M. (DE)
Johannes, F. (NL)Zdroj.dok. BMC Bioinformatics. - : BioMed Central - ISSN 1471-2105
Roč. 16, Feb 22 (2015), s. 60Poč.str. 15 s. Jazyk dok. eng - angličtina Země vyd. GB - Velká Británie Klíč. slova ChIP-seq ; histone modifications ; Hidden Markov model ; computational biology ; differential analysis Vědní obor RIV EB - Genetika a molekulární biologie CEP 7E10067 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy GA13-04420S GA ČR - Grantová agentura ČR Institucionální podpora FGU-C - RVO:67985823 UT WOS 000350370700001 EID SCOPUS 84928751959 DOI 10.1186/s12859-015-0491-6 Anotace histoneHMM is a fast algorithm written in C++ and compiled as an R package. It runs in the popular R computing environment and thus seamlessly integrates with the extensive bioinformatic tool sets available through Bioconductor. This makes histoneHMM an attractive choice for the differential analysis of ChIP-seq data. Software is available from http://histonehmm.molgen.mpg.de Pracoviště Fyziologický ústav Kontakt Lucie Trajhanová, lucie.trajhanova@fgu.cas.cz, Tel.: 241 062 400 Rok sběru 2016
Počet záznamů: 1