Počet záznamů: 1

Sequence analysis of porothramycin biosynthetic gene cluster

SYSNO ASEP	0435283
Druh ASEP	J - Článek v odborném periodiku
Zařazení RIV	J - Článek v odborném periodiku
Poddruh J	Článek ve WOS
Název	Sequence analysis of porothramycin biosynthetic gene cluster
Tvůrce(i)	Najmanová, Lucie (MBU-M)_RID Ulanová, Dana (MBU-M) Jelínková, Markéta (MBU-M) Kameník, Zdeněk (MBU-M)_{RID, ORCID} Kettnerová, Eliška (MBU-M) Koběrská, Markéta (MBU-M)_ORCID Gažák, Radek (MBU-M)_{RID, ORCID} Radojevič, Bojana (MBU-M)_RID Janata, Jiří (MBU-M)_{RID, ORCID}
Zdroj.dok.	Folia Microbiologica. - : Springer - ISSN 0015-5632 Roč. 59, č. 6 (2014), s. 543-552
Poč.str.	10 s.
Jazyk dok.	eng - angličtina
Země vyd.	CZ - Česká republika
Klíč. slova	BIOLOGICAL-ACTIVITY ; ANTHRAMYCIN ; SPECIFICITY
Vědní obor RIV	EE - Mikrobiologie, virologie
CEP	ED1.1.00/02.0109 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy
	EE2.3.20.0055 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy
	EE2.3.30.0003 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy
Institucionální podpora	MBU-M - RVO:61388971
UT WOS	000343812600013
Anotace	The biosynthetic gene cluster of porothramycin, a sequence-selective DNA alkylating compound, was identified in the genome of producing strain Streptomyces albus subsp. albus (ATCC 39897) and sequentially characterized. A 39.7 kb long DNA region contains 27 putative genes, 18 of them revealing high similarity with homologous genes from biosynthetic gene cluster of closely related pyrrolobenzodiazepine (PBD) compound anthramycin. However, considering the structures of both compounds, the number of differences in the gene composition of compared biosynthetic gene clusters was unexpectedly high, indicating participation of alternative enzymes in biosynthesis of both porothramycin precursors, anthranilate, and branched L-proline derivative. Based on the sequence analysis of putative NRPS modules Por20 and Por21, we suppose that in porothramycin biosynthesis, the methylation of anthranilate unit occurs prior to the condensation reaction, while modifications of branched proline derivative, oxidation, and dimethylation of the side chain occur on already condensed PBD core.
Pracoviště	Mikrobiologický ústav
Kontakt	Eliška Spurná, eliska.spurna@biomed.cas.cz, Tel.: 241 062 231
Rok sběru	2015

Počet záznamů: 1