Počet záznamů: 1

Reflects the coat protein variability of apple mosaic virus host preference?

SYSNO ASEP	0397847
Druh ASEP	J - Článek v odborném periodiku
Zařazení RIV	J - Článek v odborném periodiku
Poddruh J	Článek ve WOS
Název	Reflects the coat protein variability of apple mosaic virus host preference?
Tvůrce(i)	Grimová, L. (CZ) Winkowska, L. (CZ) Ryšánek, P. (CZ) Svoboda, P. (CZ) Petrzik, Karel (BC-A)_{RID, ORCID}
Zdroj.dok.	Virus Genes. - : Springer - ISSN 0920-8569 Roč. 47, č. 1 (2013), s. 119-125
Poč.str.	7 s.
Forma vydání	Tištěná - P
Jazyk dok.	eng - angličtina
Země vyd.	US - Spojené státy americké
Klíč. slova	Positive selection tests ; capsid protein ; algae host
Vědní obor RIV	EE - Mikrobiologie, virologie
Institucionální podpora	BC-A - RVO:60077344
UT WOS	000322874900015
DOI	10.1007/s11262-013-0925-z
Anotace	Apple mosaic virus (ApMV) is a widespread ssRNA virus which infects diverse species ofRosales. The phylogenetic analysis of complete capsid protein gene of the largest set of ApMV isolates discriminated two main clusters of isolates: one cluster correlates withMaloideae hosts andTrebouxialichen algae hosts; a second with hop, Prunus, and other woody tree hosts. No correlation was found between clusters and geographic origin of virus isolates, and positive selection hypothesis in distinct hosts was not confirmed: in all virus populations, purifying selection had occurred. GGT?AAT substitution resulted in Gly-Asn change inside the zinc-finger motif in the capsid protein was revealed specific for discrimination of the clusters and we hypothesise that could influence the host preference.
Pracoviště	Biologické centrum (od r. 2006)
Kontakt	Dana Hypšová, eje@eje.cz, Tel.: 387 775 214
Rok sběru	2014

Počet záznamů: 1