| SYSNO ASEP | 0370246
|
|---|
| Druh ASEP | J - Článek v odborném periodiku
|
|---|
| Zařazení RIV | J - Článek v odborném periodiku
|
|---|
| Poddruh J | Ostatní články
|
|---|
| Název | Návrh a testování specifických primerů pro detekci karanténní bakterie Xanthomonas vesicatoria
|
|---|
| Překlad názvu | Design and testing of primers specific for detection of quarantine bacterium Xanthomonas vesicatoria
|
|---|
| Tvůrce(i) | Beran, Pavel (BC-A)
Mráz, Ivan (BC-A)
|
|---|
| Celkový počet autorů | 2
|
|---|
| Zdroj.dok. | Úroda. - : Profi Press
- ISSN 0139-6013
Roč. 12, - (2011), s. 205-208
|
|---|
| Poč.str. | 4 s.
|
|---|
| Akce | Aktuální poznatky v pěstování, šlechtění, ochraně rostlin a zpracování produktů
|
|---|
| Datum konání | 15.11.2011-16.11.2011
|
|---|
| Místo konání | Brno
|
|---|
| Země | CZ - Česká republika
|
|---|
| Typ akce | CST
|
|---|
| Jazyk dok. | cze - čeština
|
|---|
| Země vyd. | CZ - Česká republika
|
|---|
| Klíč. slova | Xanthomonas vesicatoria ; PCR ; detection ; primers
|
|---|
| Vědní obor RIV | GF - Choroby, škůdci, plevely a ochrana rostlin
|
|---|
| CEP | QH71229 GA MZe - Ministerstvo zemědělství
|
|---|
| CEZ | AV0Z50510513 - UMBR-M, BC-A (2005-2011)
|
|---|
| Anotace | V této studii popisujeme vývoj metody PCR pro detekci karanténní bakterie Xanthomonas vesicatoria, která je patogenní pro rajče a papriku. Pár primerů XV1F a XV1R byl navržen na základě DNA sekvence genu atpD (získané ze sbírkového kmenu Xv CCM 2102) tak, aby byl specifický pouze pro detekci Xanthomonas vesicatoria. Tyto námi navržené primery poskytovaly (výsledný) amplifikační produkt o velikosti 356 bp a rovněž vykazovaly vysokou specifičnost. Při testování primerů na specifičnost soubor testovaných bakterií zahrnoval mnoho bakterií patogenních pro rajče a papriku (včetně rodu Xanthomonas) a některé další bakterie. K pozitivní PCR reakci však docházelo pouze tehdy, byla.-li použita templátová DNA vyizolovaná z Xanthomonas vesicatoria. Dodržením protokolu popsaném v tomto článku lze rychle a spolehlivě identifikovat bakterii Xanthomonas vesicatoria. Dle dostupných informací se jedná o první dvojici primerů, detekující specificky pouze bakteriální druh Xanthomonas vesicatoria.
|
|---|
| Překlad anotace | In this study we present development of PCR method for detection of Xanthomonas vesicatoria, the bacteria pathogenic for tomato and pepper. Primer pair XV1F and XV1R was designed based on DNA sequence of atpD gene (obtained from Xv CCM 2102 collection strain) in order to be specific for detection of Xanthomonas vesicatoria. PCR product of 326 bp was observed only if DNA isolated from Xanthomonas vesicatoria was used as a template. Collection of bacteria tested contained a lot of bacteria pathogenic for tomato and pepper (including Xanthomonas genus) and some other bacteria. Following the protocol described in this article Xanthomonas vesicatoria can be identified rapidly and reliably. To date, there is no report of such primers for specific detection of Xanthomonas vesicatoria.
|
|---|
| Pracoviště | Biologické centrum (od r. 2006)
|
|---|
| Kontakt | Dana Hypšová, eje@eje.cz, Tel.: 387 775 214
|
|---|
| Rok sběru | 2012
|
|---|
