Počet záznamů: 1
How to fragment a polypeptide? An ab initio computational study of pair interactions between amino acida and ligand-amino acids in proteins
- 1.
SYSNO ASEP 0369237 Druh ASEP J - Článek v odborném periodiku Zařazení RIV J - Článek v odborném periodiku Poddruh J Článek ve WOS Název How to fragment a polypeptide? An ab initio computational study of pair interactions between amino acida and ligand-amino acids in proteins Tvůrce(i) Klusák, Vojtěch (UOCHB-X)
Dobeš, P. (CZ)
Černý, Jiří (BTO-N) RID, ORCID
Vondrášek, Jiří (UOCHB-X) RID, ORCIDCelkový počet autorů 4 Zdroj.dok. Collection of Czechoslovak Chemical Communications. - : Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i. - ISSN 0010-0765
Roč. 76, č. 5 (2011), s. 605-618Poč.str. 14 s. Jazyk dok. eng - angličtina Země vyd. CZ - Česká republika Klíč. slova pair interactions ; amino acids ; protein stabilisation ; peptides ; correlated ab initio methods Vědní obor RIV CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie CEP GAP208/10/0725 GA ČR - Grantová agentura ČR LH11020 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy LC512 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy CEZ AV0Z40550506 - UOCHB-X (2005-2011) AV0Z50520701 - BTO-N (2007-2013) UT WOS 000290280100016 DOI 10.1135/cccc2011033 Anotace To determine reasonably which amino acid side chain contributes significantly to the stability of a protein or to the stability of a protein–ligand complex is not a straightforward task. We suggest a partial but systematic solution of the problem by a specific fragmentation of a protein chain into blocks of single amino acid side chains with their corresponding backbone part. The reference data obtained by the RI-MP2 method with the cc-pVDZ basis set were compared with RIDFT, RIDFT augmented by the dispersion term, SCC-DFTB-D and Hartree–Fock calculations. Pracoviště Ústav organické chemie a biochemie Kontakt asep@uochb.cas.cz ; Kateřina Šperková, Tel.: 232 002 584 ; Viktorie Chládková, Tel.: 232 002 434 Rok sběru 2012
Počet záznamů: 1