Počet záznamů: 1

Sequencing and assembly of low copy and genic regions of isolated Triticum aestivum chromosome arm 7DS

SYSNO ASEP	0365378
Druh ASEP	J - Článek v odborném periodiku
Zařazení RIV	J - Článek v odborném periodiku
Poddruh J	Článek ve WOS
Název	Sequencing and assembly of low copy and genic regions of isolated Triticum aestivum chromosome arm 7DS
Tvůrce(i)	Berkman, O. J. (AT) Skarshewski, A. (AU) Lorenc, M. T. (AU) Kubaláková, Marie (UEB-Q)_RID Šimková, Hana (UEB-Q)_{RID, ORCID} Batley, J. (AU) Doležel, Jaroslav (UEB-Q)_{RID, ORCID} Edwards, D. (AU)
Celkový počet autorů	17
Zdroj.dok.	Plant Biotechnology Journal. - : Wiley - ISSN 1467-7644 Roč. 9, č. 7 (2011), s. 768-775
Poč.str.	8 s.
Jazyk dok.	eng - angličtina
Země vyd.	US - Spojené státy americké
Klíč. slova	wheat genome sequence ; chromosome 7 ; genome assembly
Vědní obor RIV	EB - Genetika a molekulární biologie
CEP	GA521/07/1573 GA ČR - Grantová agentura ČR
	ED0007/01/01 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy
CEZ	AV0Z50380511 - UEB-Q (2005-2011)
UT WOS	000293659700006
DOI	10.1111/j.1467-7652.2010.00587.x
Anotace	The genome of bread wheat (Triticum aestivum) is predicted to be greater than 16 Gbp in size and consist predominantly of repetitive elements, making the sequencing and assembly of this genome a major challenge. We have reduced genome sequence complexity by isolating chromosome arm 7DS and applied second-generation technology and appropriate algorithmic analysis to sequence and assemble low copy and genic regions of this chromosome arm. The assembly represents approximately 40% of the chromosome arm and all known 7DS genes. Comparison of the 7DS assembly with the sequenced genomes of rice (Oryza sativa) and Brachypodium distachyon identified large regions of conservation. The syntenic relationship between wheat, B. distachyon and O. sativa, along with available genetic mapping data, has been used to produce an annotated draft 7DS syntenic build, which is publicly available at http://www.wheatgenome.info.
Pracoviště	Ústav experimentální botaniky
Kontakt	David Klier, knihovna@ueb.cas.cz, Tel.: 220 390 469
Rok sběru	2012

Počet záznamů: 1