Počet záznamů: 1
Photodynamics of the adenine model 4-aminopyrimidine embedded within double strand of DNA
- 1.
SYSNO ASEP 0364629 Druh ASEP J - Článek v odborném periodiku Zařazení RIV J - Článek v odborném periodiku Poddruh J Článek ve WOS Název Photodynamics of the adenine model 4-aminopyrimidine embedded within double strand of DNA Tvůrce(i) Zelený, T. (CZ)
Hobza, Pavel (UOCHB-X) RID, ORCID
Nachtigallová, Dana (UOCHB-X) RID, ORCID
Ruckenbauer, M. (AT)
Lischka, H. (AT)Celkový počet autorů 5 Zdroj.dok. Collection of Czechoslovak Chemical Communications. - : Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i. - ISSN 0010-0765
Roč. 76, č. 6 (2011), s. 631-643Poč.str. 13 s. Jazyk dok. eng - angličtina Země vyd. CZ - Česká republika Klíč. slova ab initio calculations ; excited states ; nucleic acids ; photodynamics ; QM/MM method Vědní obor RIV CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie CEP LC512 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy CEZ AV0Z40550506 - UOCHB-X (2005-2011) UT WOS 000291434900001 DOI 10.1135/cccc2011046 Anotace On-the-fly surface hopping nonadiabatic photodynamical simulations using hybrid quantum mechanical/molecular mechanical approach of 4-aminopyrimidine were performed to model the relaxation mechanism of adenine within DNA double strand. The surrounding bases do not affect the overall ring-puckering relaxation mechanisms significantly, however, interesting hydrogen-bond dynamics is observed. First, formation of intra-strand hydrogen bonds is found. It is shown that this effect speeds up the decay process. In addition, the Watson–Crick structure is altered by breaking one of the inter-strand hydrogen bonds also leading to a decrease of the life time. Pracoviště Ústav organické chemie a biochemie Kontakt asep@uochb.cas.cz ; Kateřina Šperková, Tel.: 232 002 584 ; Viktorie Chládková, Tel.: 232 002 434 Rok sběru 2012
Počet záznamů: 1