Počet záznamů: 1  

Photodynamics of the adenine model 4-aminopyrimidine embedded within double strand of DNA

  1. 1.
    SYSNO ASEP0364629
    Druh ASEPJ - Článek v odborném periodiku
    Zařazení RIVJ - Článek v odborném periodiku
    Poddruh JČlánek ve WOS
    NázevPhotodynamics of the adenine model 4-aminopyrimidine embedded within double strand of DNA
    Tvůrce(i) Zelený, T. (CZ)
    Hobza, Pavel (UOCHB-X) RID
    Nachtigallová, Dana (UOCHB-X) RID
    Ruckenbauer, M. (AT)
    Lischka, H. (AT)
    Celkový počet autorů5
    Zdroj.dok.Collection of Czechoslovak Chemical Communications. - : Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i. - ISSN 0010-0765
    Roč. 76, č. 6 (2011), s. 631-643
    Poč.str.13 s.
    Jazyk dok.eng - angličtina
    Země vyd.CZ - Česká republika
    Klíč. slovaab initio calculations ; excited states ; nucleic acids ; photodynamics ; QM/MM method
    Vědní obor RIVCF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
    CEPLC512 GA MŠk - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy
    CEZAV0Z40550506 - UOCHB-X (2005-2011)
    UT WOS000291434900001
    DOI10.1135/cccc2011046
    AnotaceOn-the-fly surface hopping nonadiabatic photodynamical simulations using hybrid quantum mechanical/molecular mechanical approach of 4-aminopyrimidine were performed to model the relaxation mechanism of adenine within DNA double strand. The surrounding bases do not affect the overall ring-puckering relaxation mechanisms significantly, however, interesting hydrogen-bond dynamics is observed. First, formation of intra-strand hydrogen bonds is found. It is shown that this effect speeds up the decay process. In addition, the Watson–Crick structure is altered by breaking one of the inter-strand hydrogen bonds also leading to a decrease of the life time.
    PracovištěÚstav organické chemie a biochemie
    KontaktJana Procházková, janap@uochb.cas.cz, Tel.: 220 183 418 ; Viktorie Chládková, viktorie.chladkova@uochb.cas.cz, Tel.: 232 002 434
    Rok sběru2012