Počet záznamů: 1
Structural dynamics of thrombin-binding DNA aptamer d(GGTTGGTGTGGTTGG) quadruplex DNA studied by large-scale explicit solvent simulations
- 1.
SYSNO ASEP 0353799 Druh ASEP J - Článek v odborném periodiku Zařazení RIV J - Článek v odborném periodiku Poddruh J Článek ve WOS Název Structural dynamics of thrombin-binding DNA aptamer d(GGTTGGTGTGGTTGG) quadruplex DNA studied by large-scale explicit solvent simulations Tvůrce(i) Reshetnikov, R. (RU)
Golovin, A. (RU)
Spiridonova, V. (RU)
Kopylov, A. (RU)
Šponer, Jiří (BFU-R) RID, ORCIDCelkový počet autorů 5 Zdroj.dok. Journal of Chemical Theory and Computation . - : American Chemical Society - ISSN 1549-9618
Roč. 6, č. 10 (2010), s. 3003-3014Poč.str. 12 s. Jazyk dok. eng - angličtina Země vyd. US - Spojené státy americké Klíč. slova molecular dynamics ; quadruplex DNA ; thrombin Vědní obor RIV BO - Biofyzika CEP IAA400040802 GA AV ČR - Akademie věd GA203/09/1476 GA ČR - Grantová agentura ČR LC06030 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy CEZ AV0Z50040507 - BFU-R (2005-2011) AV0Z50040702 - BFU-R (2007-2013) UT WOS 000282840600001 DOI 10.1021/ct100253m Anotace The thrombin-binding aptamer (15-TBA) is a 15-mer DNA oligonucleotide with sequence d(GGTTGGTGTGGTTGG). 15-TBA folds into a quadruplex DNA (G-DNA) structure with two planar G-quartets connected by three single-stranded loops. In the present study, the explicit solvent molecular dynamics (MD) simulation method was utilized to analyze the 15-TBA-thrombin threedimensional structure. Pracoviště Biofyzikální ústav Kontakt Jana Poláková, polakova@ibp.cz, Tel.: 541 517 244 Rok sběru 2011
Počet záznamů: 1