Počet záznamů: 1
Structural dynamics of the box C/D RNA Kink-Turn and its complex with proteins: The role of the A-minor 0 interaction, long-residency water bridges, and structural ion-binding sites revealed by molecular simulations
- 1.
SYSNO ASEP 0347728 Druh ASEP J - Článek v odborném periodiku Zařazení RIV J - Článek v odborném periodiku Poddruh J Článek ve WOS Název Structural dynamics of the box C/D RNA Kink-Turn and its complex with proteins: The role of the A-minor 0 interaction, long-residency water bridges, and structural ion-binding sites revealed by molecular simulations Tvůrce(i) Špačková, Naďa (BFU-R) RID
Réblová, Kamila (BFU-R)
Šponer, Jiří (BFU-R) RID, ORCIDCelkový počet autorů 3 Zdroj.dok. Journal of Physical Chemistry B. - : American Chemical Society - ISSN 1520-6106
Roč. 114, č. 32 (2010), s. 10581-10593Poč.str. 13 s. Jazyk dok. eng - angličtina Země vyd. US - Spojené státy americké Klíč. slova RNA-protein complex ; molecular dynamics ; kink-turn Vědní obor RIV BO - Biofyzika CEP LC06030 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy KJB400040901 GA AV ČR - Akademie věd IAA400040802 GA AV ČR - Akademie věd GA203/09/1476 GA ČR - Grantová agentura ČR CEZ AV0Z50040507 - BFU-R (2005-2011) AV0Z50040702 - BFU-R (2007-2013) UT WOS 000280727700040 DOI 10.1021/jp102572k Anotace The study is focused on investigation of Box C/D RNA Kink-Turn with two proteins: native archaeal L7ae protein and human 15.5 kDa protein. The simulations reveal structural details of the studied molecules on nanosecond time scale, i.e. structural dynamics of essential tertiary interaction within kink-turn, reduced kink-turn flexibility upon protein binding, structurally important water molecules and ion binding sites. Pracoviště Biofyzikální ústav Kontakt Jana Poláková, polakova@ibp.cz, Tel.: 541 517 244 Rok sběru 2011
Počet záznamů: 1