Počet záznamů: 1
Terminal restriction fragment length measurement errors are affected mainly by fragment length, G+C nucleotide content and secondary structure melting point
- 1.
SYSNO ASEP 0347130 Druh ASEP J - Článek v odborném periodiku Zařazení RIV J - Článek v odborném periodiku Poddruh J Článek ve WOS Název Terminal restriction fragment length measurement errors are affected mainly by fragment length, G+C nucleotide content and secondary structure melting point Tvůrce(i) Bukovská, Petra (BU-J)
Jelínková, Markéta (MBU-M)
Hršelová, Hana (MBU-M) RID, ORCID
Sýkorová, Zuzana (BU-J) RID
Gryndler, Milan (MBU-M) RID, ORCIDCelkový počet autorů 5 Zdroj.dok. Journal of Microbiological Methods. - : Elsevier - ISSN 0167-7012
Roč. 82, č. 3 (2010), s. 223-228Poč.str. 6 s. Jazyk dok. eng - angličtina Země vyd. NL - Nizozemsko Klíč. slova T-RFLP ; drift ; DNA fragment Vědní obor RIV EF - Botanika CEP 1M0571 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy CEZ AV0Z60050516 - BU-J (2005-2011) AV0Z50200510 - MBU-M (2005-2011) UT WOS 000282113000005 DOI 10.1016/j.mimet.2010.06.007 Anotace Several methods of molecular analysis of microbial diversity, including terminal restriction fragment length polymorphism (T-RFLP) analysis are based on measurement of the DNA fragment length. Significant variation between sequence-determined and measured length of restriction fragments (drift) has been observed, which can affect the efficiency of the identification of microorganisms in the analyzed communities. In this study, principal component analysis and multiple regression analysis revealed that secondary structure melting point and G+C nucleotide content, besides the fragment length, contribute to the variation observed, whereas the contribution of purine Pracoviště Botanický ústav Kontakt Martina Bartošová, martina.bartosova@ibot.cas.cz, ibot@ibot.cas.cz, Tel.: 271 015 242 ; Marie Jakšová, marie.jaksova@ibot.cas.cz, Tel.: 384 721 156-8 Rok sběru 2011
Počet záznamů: 1