Počet záznamů: 1
Does Stacking Restrain the Photodynamics of Individual Nucleobases?
- 1.
SYSNO ASEP 0346458 Druh ASEP J - Článek v odborném periodiku Zařazení RIV J - Článek v odborném periodiku Poddruh J Článek ve WOS Název Does Stacking Restrain the Photodynamics of Individual Nucleobases? Tvůrce(i) Nachtigallová, Dana (UOCHB-X) RID, ORCID
Zelený, T. (CZ)
Ruckenbauer, M. (AT)
Müller, T. (DE)
Barbatti, M. (AT)
Hobza, Pavel (UOCHB-X) RID, ORCID
Lischka, Hans (UOCHB-X)Celkový počet autorů 7 Zdroj.dok. Journal of the American Chemical Society. - : American Chemical Society - ISSN 0002-7863
Roč. 132, č. 24 (2010), s. 8261-8263Poč.str. 3 s. Jazyk dok. eng - angličtina Země vyd. US - Spojené státy americké Klíč. slova excited states dynamics ; nucleobases ; QM/MM method Vědní obor RIV CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie CEP LC512 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy CEZ AV0Z40550506 - UOCHB-X (2005-2011) UT WOS 000278905700016 DOI https://doi.org/10.1021/ja1029705 Anotace Nonadiabatic photodynamical simulations of 4-aminopyrimidine (4-APy) used as a model for adenine were performed by embedding it between two stacking methyl-guanine (mGua) molecules to determine the effect of spatial restrictions on the ultrafast photodeactivation mechanism of this nucleobase. During the dynamics the formation of a significant fraction of intrastrand hydrogen bonding from 4-APy to mGua above and below is observed. These findings show that this type of hydrogen bond may play an important role for the photodynamics within one DNA strand and that it should be of interest even in irregular segments of double stranded nucleic acids structures. The relaxation mechanism of internal conversion to the ground state is dominated by ring puckering, and an overall elongation of the lifetime by -20% as compared to the isolated 4-APy is computed. Pracoviště Ústav organické chemie a biochemie Kontakt asep@uochb.cas.cz ; Kateřina Šperková, Tel.: 232 002 584 ; Jana Procházková, Tel.: 220 183 418 Rok sběru 2011
Počet záznamů: 1