Počet záznamů: 1  

Softwarová implementace kompenzace jasových nehomogenit mikroskopických obrazů v ploše, využívající horní Lipschitzův obal

  1. 1.
    SYSNO ASEP0338930
    Druh ASEPL4 - Software
    Zařazení RIVR - Software
    NázevSoftwarová implementace kompenzace jasových nehomogenit mikroskopických obrazů v ploše, využívající horní Lipschitzův obal
    Překlad názvuSoftware Implementation of Compensation of Illumination Inhomogeneities of Microscopic Images, Using the Upper Lipschitz Cover
    Tvůrce(i) Michálek, Jan (FGU-C) RID
    Čapek, Martin (FGU-C) RID, ORCID
    Janáček, Jiří (FGU-C) RID, ORCID
    Kubínová, Lucie (FGU-C) RID, ORCID
    Rok vydání2009
    Int.kódPlaneBrightnessAdjusting
    Lokalizace výsledkuFyziologický ústav AVČR v. v. i.
    Technické parametryProgramovací jazyk C++, vývojové prostředí MS Visual Studio 2008
    Název vlastníkaFyziologický ústav AVČR v. v. i.
    IČ vlastníka67985823
    Využ. jiným subjektemP - Využití výsledku jiným subjektem je v některých případech možné bez nabytí licence
    Požad. na licenč. popl.Z - Poskytovatel licence nepožaduje v některých případech licenční poplatek
    Jazyk dok.cze - čeština
    Země vlastníkaCZ - Česká republika
    Klíč. slovaiIllumination inhomogeneities ; confocal microscope ; Lipschitz cover
    Vědní obor RIVJC - Počítačový hardware a software
    CEPGA102/08/0691 GA ČR - Grantová agentura ČR
    LC06063 GA MŠk - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy
    CEZAV0Z50110509 - FGU-C (2005-2011)
    AnotaceFluorescenční obrazy nasnímané konfokální laserovou rastrovací mikroskopií (CLSM) z různých hloubek biologického vzorku jsou často používány na 3D rekonstrukci biologického objemu.V ideálním případě, konfokální obrázek regionu odpovídající stejné koncentraci fluoreskujícího barviva ve vzorku by měl být mapován na stejné úrovně šedi. V praxi se bohužel ani ideálně homogenní vzorky, jako jsou kalibrační mřížky, nevyhnou ztmavnutí obrazu hran, jasovému zvýraznění centra atd. Účinky jsou ještě výraznější u obrazů reálných biologických vzorků. Naše řešení problému se opírá o odhad zisku prostorové proměnné, která modeluje nepříznivé účinky nerovnoměrného osvětlení a o opravu obrázku převrácením odhadu hodnoty zisku. Navrhovaný přístup využívá rychlou implementaci morfologické operace s názvem Lipschitzův horní obal. Odpovídající zásuvný programový modul byl implementován pro modulární balík software Ellipse
    Překlad anotaceSeries of stacks of fluorescent images captured by a confocal laser scanning microscope (CLSM) from different depths of a biological specimen are often used, e.g., to produce 3D representation of the underlying biological volume. Ideally, CLSM image regions corresponding to the same concentration of fluorescent dye in the specimen should be mapped to the same greyscale levels. In practice, unfortunately, even ideally homogeneous specimens like artificial calibration grids exhibit darkening of image edges, lightening of the centre etc. Our solution to the problem relies on estimating a spatially variable gain which models the adverse effects of uneven illumination, and correcting images by inverting the estimated gain. The proposed approach exploits fast implementation of a morphological operation called the upper Lipschitz cover. A corresponding plug-in module was implemented for the modular Ellipse software package
    PracovištěFyziologický ústav
    KontaktLucie Trajhanová, lucie.trajhanova@fgu.cas.cz, Tel.: 241 062 400
    Rok sběru2010
Počet záznamů: 1