Počet záznamů: 1
Softwarová implementace kompenzace jasových nehomogenit mikroskopických obrazů v ploše, využívající horní Lipschitzův obal
- 1.
SYSNO ASEP 0338930 Druh ASEP L4 - Software Zařazení RIV R - Software Název Softwarová implementace kompenzace jasových nehomogenit mikroskopických obrazů v ploše, využívající horní Lipschitzův obal Překlad názvu Software Implementation of Compensation of Illumination Inhomogeneities of Microscopic Images, Using the Upper Lipschitz Cover Tvůrce(i) Michálek, Jan (FGU-C) RID
Čapek, Martin (FGU-C) RID, ORCID
Janáček, Jiří (FGU-C) RID, ORCID
Kubínová, Lucie (FGU-C) RID, ORCIDRok vydání 2009 Int.kód PlaneBrightnessAdjusting Lokalizace výsledku Fyziologický ústav AVČR v. v. i. Technické parametry Programovací jazyk C++, vývojové prostředí MS Visual Studio 2008 Název vlastníka Fyziologický ústav AVČR v. v. i. IČ vlastníka 67985823 Využ. jiným subjektem P - Využití výsledku jiným subjektem je v některých případech možné bez nabytí licence Požad. na licenč. popl. Z - Poskytovatel licence nepožaduje v některých případech licenční poplatek Jazyk dok. cze - čeština Země vlastníka CZ - Česká republika Klíč. slova iIllumination inhomogeneities ; confocal microscope ; Lipschitz cover Vědní obor RIV JC - Počítačový hardware a software CEP GA102/08/0691 GA ČR - Grantová agentura ČR LC06063 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy CEZ AV0Z50110509 - FGU-C (2005-2011) Anotace Fluorescenční obrazy nasnímané konfokální laserovou rastrovací mikroskopií (CLSM) z různých hloubek biologického vzorku jsou často používány na 3D rekonstrukci biologického objemu.V ideálním případě, konfokální obrázek regionu odpovídající stejné koncentraci fluoreskujícího barviva ve vzorku by měl být mapován na stejné úrovně šedi. V praxi se bohužel ani ideálně homogenní vzorky, jako jsou kalibrační mřížky, nevyhnou ztmavnutí obrazu hran, jasovému zvýraznění centra atd. Účinky jsou ještě výraznější u obrazů reálných biologických vzorků. Naše řešení problému se opírá o odhad zisku prostorové proměnné, která modeluje nepříznivé účinky nerovnoměrného osvětlení a o opravu obrázku převrácením odhadu hodnoty zisku. Navrhovaný přístup využívá rychlou implementaci morfologické operace s názvem Lipschitzův horní obal. Odpovídající zásuvný programový modul byl implementován pro modulární balík software Ellipse Překlad anotace Series of stacks of fluorescent images captured by a confocal laser scanning microscope (CLSM) from different depths of a biological specimen are often used, e.g., to produce 3D representation of the underlying biological volume. Ideally, CLSM image regions corresponding to the same concentration of fluorescent dye in the specimen should be mapped to the same greyscale levels. In practice, unfortunately, even ideally homogeneous specimens like artificial calibration grids exhibit darkening of image edges, lightening of the centre etc. Our solution to the problem relies on estimating a spatially variable gain which models the adverse effects of uneven illumination, and correcting images by inverting the estimated gain. The proposed approach exploits fast implementation of a morphological operation called the upper Lipschitz cover. A corresponding plug-in module was implemented for the modular Ellipse software package Pracoviště Fyziologický ústav Kontakt Lucie Trajhanová, lucie.trajhanova@fgu.cas.cz, Tel.: 241 062 400 Rok sběru 2010
Počet záznamů: 1