Počet záznamů: 1
Concatenated SSU and LSU rDNA data confirm the main evolutionary trends within myxosporeans (Myxozoa: Myxosporea) and provide effective tool for their molecular phylogenetics
- 1.
SYSNO ASEP 0334902 Druh ASEP J - Článek v odborném periodiku Zařazení RIV J - Článek v odborném periodiku Poddruh J Článek ve WOS Název Concatenated SSU and LSU rDNA data confirm the main evolutionary trends within myxosporeans (Myxozoa: Myxosporea) and provide effective tool for their molecular phylogenetics Překlad názvu Spojená SSU a LSU rDNA data potvrzují hlavní evoluční směry myxosporeí (Myxozoa: Myxosporea) a poskytují účinný nástroj pro rekonstrukci jejich fylogeneze Tvůrce(i) Bartošová, Pavla (BC-A) RID, ORCID
Fiala, Ivan (BC-A) RID, ORCID
Hypša, Václav (BC-A) RIDZdroj.dok. Molecular Phylogenetics and Evolution. - : Elsevier - ISSN 1055-7903
Roč. 53, č. 1 (2009), s. 81-93Poč.str. 12 s. Jazyk dok. eng - angličtina Země vyd. US - Spojené státy americké Klíč. slova myxosporea ; phylogeny ; LBA ; LSU rDNA ; 28S ; SSU rDNA ; 18S ; D domains Vědní obor RIV EG - Zoologie CEP KJB600960701 GA AV ČR - Akademie věd LC522 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy CEZ AV0Z60220518 - PAU-O, BC-A (2005-2011) UT WOS 000269067900008 DOI 10.1016/j.ympev.2009.05.018 Anotace Views on myxosporean phylogeny and systematics have recently undergone substantial changes resulting from analyses of SSU rDNA. Here, we further investigate the evolutionary trends within myxosporean lineages by using 35 new sequences of the LSU rDNA. We show a good agreement between the two rRNA genes and confirm the main phylogenetic split between the freshwater and marine lineages. The informative superiority of the LSU data is shown by an increase of the resolution, nodal supports and tree indexes in the LSU rDNA and combined analyses. We determine the most suitable part of LSU for the myxosporean phylogeny by comparing informative content in various regions of the LSU sequences. Based on this comparison, we propose the D5–3′-end part of the LSU rRNA gene as the most informative region which provides in concatenation with the complete SSU a well resolved and robust tree. To allow for simple amplification of the marker, we design specific primer set for this part of LSU rDNA. Pracoviště Biologické centrum (od r. 2006) Kontakt Dana Hypšová, eje@eje.cz, Tel.: 387 775 214 Rok sběru 2010
Počet záznamů: 1