Počet záznamů: 1
Nanosecond Time-Dependent Stokes Shift at the Tunnel Mouth of Haloalkane Dehalogenases
- 1.
SYSNO ASEP 0333807 Druh ASEP J - Článek v odborném periodiku Zařazení RIV J - Článek v odborném periodiku Poddruh J Článek ve WOS Název Nanosecond Time-Dependent Stokes Shift at the Tunnel Mouth of Haloalkane Dehalogenases Překlad názvu Časově závislý Stokesův posuv v blízkosti aktivního místa Haloalkan- Dehalogenaz Tvůrce(i) Jesenská, A. (CZ)
Sýkora, Jan (UFCH-W) RID
Olžyńska, Agnieszka (UFCH-W) RID
Brezovský, J. (CZ)
Zdráhal, Z. (CZ)
Damborský, J. (CZ)
Hof, Martin (UFCH-W) RID, ORCIDZdroj.dok. Journal of the American Chemical Society. - : American Chemical Society - ISSN 0002-7863
Roč. 131, č. 2 (2009), s. 494-501Poč.str. 8 s. Jazyk dok. eng - angličtina Země vyd. US - Spojené státy americké Klíč. slova crystallographic analysis ; active-site dynamics ; solvent relaxation Vědní obor RIV CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie CEP GA203/08/0114 GA ČR - Grantová agentura ČR LC06063 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy LC06010 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy CEZ AV0Z40400503 - UFCH-W (2005-2011) UT WOS 000262521800036 DOI 10.1021/ja804020q Anotace The tunnel mouths are evolutionally the most variable regions in the structures of haloalkane dehalogenases originating from different bacterial species, suggesting their importance for adaptation of enzymes to various substrates. We decided to monitor the dynamics of this particular region by means of time-resolved fluorescence spectroscopy and molecular dynamic simulations. To label the enzyme specifically, we adapted a novel procedure that utilizes a coumarin dye containing a halide-hydrocarbon linker, which serves as a substrate for enzymatic reaction. The procedure leads to a coumarin dye covalently attached and specifically located in the tunnel mouth of the enzyme. In this manner, we stained two haloalkane dehalogenase mutants, DbjA-H280F and DhaA-H272F. Pracoviště Ústav fyzikální chemie J.Heyrovského Kontakt Michaela Knapová, michaela.knapova@jh-inst.cas.cz, Tel.: 266 053 196 Rok sběru 2010
Počet záznamů: 1