Počet záznamů: 1
Elbow flexibility of the kt38 RNA kink-turn motif investigated by free-energy molecular dynamics simulations
- 1.
SYSNO ASEP 0331241 Druh ASEP J - Článek v odborném periodiku Zařazení RIV J - Článek v odborném periodiku Poddruh J Článek ve WOS Název Elbow flexibility of the kt38 RNA kink-turn motif investigated by free-energy molecular dynamics simulations Překlad názvu Flexibilita kink turn motivu 38 studovaná molekulově dynamickými simulacemi Tvůrce(i) Curuksu, J. (DE)
Šponer, Jiří (BFU-R) RID, ORCID
Zacharias, M. (DE)Celkový počet autorů 3 Zdroj.dok. Biophysical Journal. - : Cell Press - ISSN 0006-3495
Roč. 97, č. 7 (2009), s. 2004-2013Poč.str. 10 s. Jazyk dok. eng - angličtina Země vyd. US - Spojené státy americké Klíč. slova umbrella-sampling ; molecular dynamics ; A-minor interaction Vědní obor RIV BO - Biofyzika CEP IAA400040802 GA AV ČR - Akademie věd CEZ AV0Z50040507 - BFU-R (2005-2011) AV0Z50040702 - BFU-R (2007-2013) UT WOS 000270586000023 DOI 10.1016/j.bpj.2009.07.031 Anotace Umbrella-sampling molecular dynamics simulations were used to disrupt an A-minor interaction in the ribosomal kt38 turn and to calculate the associated free-energy change. The simulations revealed a coupled A-minor disruption and global opening of the K-turn motif, and allowed us to characterize several intermediate A-minor conformations. Pracoviště Biofyzikální ústav Kontakt Jana Poláková, polakova@ibp.cz, Tel.: 541 517 244 Rok sběru 2010
Počet záznamů: 1