Počet záznamů: 1
Volume Reconstruction Using Confocal Microscopy Images and Correction of Deformations by Elastic Registration
- 1.
SYSNO ASEP 0329247 Druh ASEP C - Konferenční příspěvek (mezinárodní konf.) Zařazení RIV D - Článek ve sborníku Název Volume Reconstruction Using Confocal Microscopy Images and Correction of Deformations by Elastic Registration Překlad názvu Objemová rekonstrukce s využitím konfokálních obrazů a korekce deformací elastickou registrací Tvůrce(i) Čapek, Martin (FGU-C) RID, ORCID
Brůža, Petr (FGU-C)
Kocandová, Lucie (FGU-C)
Janáček, Jiří (FGU-C) RID, ORCID
Kubínová, Lucie (FGU-C) RID, ORCID
Hozman, J. (CZ)
Kneppo, P. (CZ)
Vagnerová, R. (CZ)Zdroj.dok. Stereology and Image Analysis. - Bologna : Esculapio, 2009 / Capasso V. ; Aletti G. ; Micheletti A. - ISBN 978-88-7488-310-3 Rozsah stran s. 538-543 Poč.str. 6 s. Akce European Congress of Stereology and Image Analysis /10./ Datum konání 22.06.2009-26.06.2009 Místo konání Milano Země IT - Itálie Typ akce EUR Jazyk dok. eng - angličtina Země vyd. IT - Itálie Klíč. slova 3D reconstruction ; elastic registration ; 3D visualization ; confocal microscopy Vědní obor RIV JC - Počítačový hardware a software CEP IAA100110502 GA AV ČR - Akademie věd GA102/08/0691 GA ČR - Grantová agentura ČR GA304/09/0733 GA ČR - Grantová agentura ČR LC06063 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy CEZ AV0Z50110509 - FGU-C (2005-2011) Anotace A set of methods leading to volume reconstruction of biological specimens larger than the field of view of a confocal laser scanning microscope (CLSM) is presented. Large tissue specimens are cut into thin physical slices and volume data sets are captured from all studied physical slices by CLSM. Overlapping spatial tiles of the same physical slice are stitched in horizontal direction. Image volumes of successive physical slices are linked in axial direction by applying an elastic registration algorithm to compensate for deformations due to cutting the specimen. We present a method enabling us to keep true object morphology using a-priori information about the shape and size of the specimen, available from images of the cutting planes captured by a USB light microscope immediately before cutting the specimen by a microtome. The errors introduced by elastic registration are evaluated using a stereological point counting method and the Procrustes distance Pracoviště Fyziologický ústav Kontakt Lucie Trajhanová, lucie.trajhanova@fgu.cas.cz, Tel.: 241 062 400 Rok sběru 2010
Počet záznamů: 1