Počet záznamů: 1
Single stranded loops of quadruplex DNA as key benchmark for testing nucleic acids force fields
- 1.
SYSNO ASEP 0329244 Druh ASEP J - Článek v odborném periodiku Zařazení RIV J - Článek v odborném periodiku Poddruh J Článek ve WOS Název Single stranded loops of quadruplex DNA as key benchmark for testing nucleic acids force fields Překlad názvu Jednořetězcové smyčky DNA kvadruplexů jako klíčový benchmark pro testování silových polí pro nukleové kyseliny Tvůrce(i) Fadrná, E. (CZ)
Špačková, Naďa (BFU-R) RID
Sarzynska, J. (PL)
Koča, J. (CZ)
Orozco, M. (ES)
Cheatham III, T.E. (US)
Kulinski, T. (PL)
Šponer, Jiří (BFU-R) RID, ORCIDZdroj.dok. Journal of Chemical Theory and Computation . - : American Chemical Society - ISSN 1549-9618
Roč. 5, č. 9 (2009), s. 2514-2530Poč.str. 17 s. Jazyk dok. eng - angličtina Země vyd. US - Spojené státy americké Klíč. slova DNA quadruplex ; MD simulation ; force fields Vědní obor RIV BO - Biofyzika CEP LC06030 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy 1QS500040581 GA AV ČR - Akademie věd IAA400040802 GA AV ČR - Akademie věd CEZ AV0Z50040507 - BFU-R (2005-2011) AV0Z50040702 - BFU-R (2007-2013) UT WOS 000269488300031 DOI 10.1021/ct900200k Anotace We have carried out a set of explicit solvent molecular dynamics (MD) simulations on two DNA quadruplex (G-DNA) molecules. The main purpose of the paper was testing of the capability of the MD simulation technique to describe single-stranded topologies of G-DNA loops, which represent a very challenging task for computational methods. Pracoviště Biofyzikální ústav Kontakt Jana Poláková, polakova@ibp.cz, Tel.: 541 517 244 Rok sběru 2010
Počet záznamů: 1