Počet záznamů: 1
Loss of dispersion energy changes the stability and folding/unfolding equilibrium of the Trp-Cage protein
- 1.
SYSNO ASEP 0324791 Druh ASEP J - Článek v odborném periodiku Zařazení RIV J - Článek v odborném periodiku Poddruh J Článek ve WOS Název Loss of dispersion energy changes the stability and folding/unfolding equilibrium of the Trp-Cage protein Překlad názvu Ztráta disperzní energie má vliv na stabilitu a nativní/denaturovaný rovnovážný stav Trp-Cage proteinu Tvůrce(i) Černý, Jiří (BTO-N) RID, ORCID
Vondrášek, Jiří (UOCHB-X) RID, ORCID
Hobza, Pavel (UOCHB-X) RID, ORCIDCelkový počet autorů 3 Zdroj.dok. Journal of Physical Chemistry B. - : American Chemical Society - ISSN 1520-6106
Roč. 113, č. 16 (2009), s. 5657-5660Poč.str. 4 s. Jazyk dok. eng - angličtina Země vyd. US - Spojené státy americké Klíč. slova Trp-Cage protein ; dispersion energy ; protein folding Vědní obor RIV CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie CEP LC512 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy GA203/06/1727 GA ČR - Grantová agentura ČR CEZ AV0Z40550506 - UOCHB-X (2005-2011) AV0Z50520701 - BTO-N (2007-2013) UT WOS 000265269100038 DOI 10.1021/jp9004746 Anotace The structure of proteins as well as their folding/unfolding equilibrium are commonly attributed to H-bonding and hydrophobic interactions. We have used the molecular dynamic simulations in an explicit water environment based on the standard empirical potential as well as more accurately (and thus also more reliably) on the QM/MM potential. The simulations where the dispersion term was suppressed have led to a substantial change of the tryptophan-cage protein structure (unfolded structure). This structure cannot fold without the dispersion energy term, whereas, if it is covered fully, the system finds its native structure relatively quickly. Pracoviště Biotechnologický ústav Kontakt Monika Kopřivová, Monika.Koprivova@ibt.cas.cz, Tel.: 325 873 700 Rok sběru 2009
Počet záznamů: 1