Počet záznamů: 1
Processed pseudogenes of human endogenous retroviruses generated by LINEs: their integration, stability, and distribution
- 1.
SYSNO ASEP 0108987 Druh ASEP J - Článek v odborném periodiku Zařazení RIV J - Článek v odborném periodiku Poddruh J Ostatní články Název Processed pseudogenes of human endogenous retroviruses generated by LINEs: their integration, stability, and distribution Překlad názvu Procesované pseudogeny lidských endogenních retrovirů generovaných LINE: jejich integrace, stabilita a distribuce Tvůrce(i) Pavlíček, Adam (UMG-J)
Pačes, Jan (UMG-J) RID, ORCID
Elleder, Daniel (UMG-J) RID
Hejnar, Jiří (UMG-J) RIDZdroj.dok. Genome Research. - : Cold Spring Harbor Laboratory Press - ISSN 1088-9051
Roč. 12, č. 3 (2002), s. 391-399Poč.str. 9 s. Jazyk dok. eng - angličtina Země vyd. US - Spojené státy americké Klíč. slova pseudogenes ; HERV ; LINE Vědní obor RIV EB - Genetika a molekulární biologie CEP GA204/01/0632 GA ČR - Grantová agentura ČR LN00A079 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy CEZ AV0Z5052915 - UMG-J Anotace We report here the presence of numerous processed pseudogenes derived from the W family of endogenous retroviruses in the human genome. These pseudogenes are structurally colinear with the retroviral mRNA followed by a poly(A) tail. Our analysis of insertion sites of HERV-W processed pseudogenes shows a strong preference for the insertion motif of long interspersed nuclear element (LINE) retrotransposons. The genomic distribution, stability during evolution, and frequent truncations at the 5´ end resemble those of the pseudogenes generated by LINEs. We therefore suggest that HERV-W processed pseudogenes arose by multiple and independent LINE-mediated retrotransposition of retroviral mRNA. These data document that the majority of HERV-W copies are actually nontranscribed promoterless pseudogenes. The current search for HERV-Ws associated with several human diseases should concentrate on a small subset of transcriptionally competent elements Pracoviště Ústav molekulární genetiky Kontakt Nikol Škňouřilová, nikol.sknourilova@img.cas.cz, Tel.: 241 063 217 Rok sběru 2005
Počet záznamů: 1