Počet záznamů: 1
Impact of an extruded nucleotide on cleavage activity and dynamic catalytic core conformation of the hepatitis delta virus ribozyme
- 1.
SYSNO ASEP 0081633 Druh ASEP J - Článek v odborném periodiku Zařazení RIV J - Článek v odborném periodiku Poddruh J Ostatní články Název Impact of an extruded nucleotide on cleavage activity and dynamic catalytic core conformation of the hepatitis delta virus ribozyme Překlad názvu Vliv vytěsněného nukleotidu na aktivitu štěpení a konformační dynamiku katalytického jádra hepatitis delta virus ribozymu Tvůrce(i) Šefčíková, J. (US)
Krasovská, Maryna V. (BFU-R)
Špačková, Naďa (BFU-R) RID
Šponer, Jiří (BFU-R) RID, ORCID
Walter, N.G. (US)Zdroj.dok. Biopolymers - ISSN 0006-3525
Roč. 85, 5-6 (2007), s. 392-406Poč.str. 15 s. Jazyk dok. eng - angličtina Země vyd. US - Spojené státy americké Klíč. slova conformational dynamics ; hepatitis delta virus ; molecular dynamics Vědní obor RIV BO - Biofyzika CEP GA203/05/0388 GA ČR - Grantová agentura ČR GA203/05/0009 GA ČR - Grantová agentura ČR 1QS500040581 GA AV ČR - Akademie věd LC512 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy CEZ AV0Z50040702 - BFU-R (2007-2013) Anotace The self-cleaving hepatitis delta virus (HDV) ribozyme is essential for the replication of HDV, a liver disease causing pathogen in humans. The catalytically critical nucleotide C75 of the ribozyme is buttressed by a trefoil turn pivoting around an extruded G76. In all available crystal structures, the conformation of G76 is restricted by stacking with G76 of a neighboring molecule. To test whether this crystal contact introduces a structural perturbation into a catalytic core, we have analyzed ~200 ns of molecular dynamics simulations. Pracoviště Biofyzikální ústav Kontakt Jana Poláková, polakova@ibp.cz, Tel.: 541 517 244 Rok sběru 2007
Počet záznamů: 1