Počet záznamů: 1

Methods for compensation of the light attenuation with depth of images captured by a confocal microscope

SYSNO ASEP	0049753
Druh ASEP	J - Článek v odborném periodiku
Zařazení RIV	J - Článek v odborném periodiku
Poddruh J	Ostatní články
Název	Methods for compensation of the light attenuation with depth of images captured by a confocal microscope
Překlad názvu	Metody kompenzace útlumu jasu s hloubkou obrazů získaných konfokálním mikroskopem
Tvůrce(i)	Čapek, Martin (FGU-C)_{RID, ORCID} Janáček, Jiří (FGU-C)_{RID, ORCID} Kubínová, Lucie (FGU-C)_{RID, ORCID}
Zdroj.dok.	Microscopy Research and Technique - ISSN 1059-910X Roč. 69, č. 8 (2006), s. 624-635
Poč.str.	12 s.
Jazyk dok.	eng - angličtina
Země vyd.	US - Spojené státy americké
Klíč. slova	image enhancement ; confocal microscopy ; histogram warping
Vědní obor RIV	JC - Počítačový hardware a software
CEP	LC06063 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy
	IAA100110502 GA AV ČR - Akademie věd
	IAA600110507 GA AV ČR - Akademie věd
	IAA500200510 GA AV ČR - Akademie věd
	KJB6011309 GA AV ČR - Akademie věd
	GA304/05/0153 GA ČR - Grantová agentura ČR
CEZ	AV0Z50110509 - FGU-C (2005-2011)
Anotace	A confocal laser scanning microscope (CLSM) enables us to capture images from a biological specimen in different depths and obtain a series of precisely registered fluorescent images. But images captured from deep layers of the specimen may be darker than images from the topmost layers due to light loss distortions. This effect causes difficulties in subsequent analysis of biological objects. We propose a solution using two approaches: either an online method working already during image acquisition, or an offline method assisting as a post-processing step. In the online method the gain value of a photomultiplier tube of a CLSM is controlled according to the difference of mean image intensities between the reference and currently acquired image. The offline method consists of two stages. In the first stage a standard histogram improving brightness and contrast is created from all images in the series. In the second stage image histograms are warped according to this standard histogram
Pracoviště	Fyziologický ústav
Kontakt	Lucie Trajhanová, lucie.trajhanova@fgu.cas.cz, Tel.: 241 062 400
Rok sběru	2007

Počet záznamů: 1