Počet záznamů: 1  

Draft assembly genomu Embiratermes neotenicus

  1. 1.
    Hlavní název datového souboruDraft assembly genomu Embiratermes neotenicus
    Překlad názvu do angličtinyDraft assembly of the Embiratermes neotenicus genome
    Alternativní název souboruEmbiratermes neotenicus genome
    Tvůrce(i) Lukšan, Ondřej (UOCHB-X) ORCID
    Typ datových souborůDataset
    Jazykangličtina
    Popis datasetuGenomové assembly tvořené 4512 contigy o celkové velikosti 1,38 Gb byl sestaven na základě dlouhých sekvenačních čtení technologie Oxford Nanopore pomocí algoritmu Flye v2.9.4. Dataset sestává z následujících pěti souborů:
    * eneotenicus-genome_v1.fa - genomové assembly ve formátu FASTA
    * eneotenicus-genome_v1.gtf - anotace ve formátu GTF
    * eneotenicus-genome_v1.cds - anotované protein-kódující sekvence ve formátu FASTA
    * eneotenicus-genome_v1.aa - anotované proteinové sekvence ve formátu FASTA
    Překlad popisu datasetu do angličtinyDraft genome consistng of 4512 contigs and ranging 1.38 Gb was assembled from Oxford nanopore long sequence reads using the Flye v2.9.4 algorithm. The dataset includes following five files:
    * eneotenicus-genome_v1.fa - draft genome assembly in FASTA format
    * eneotenicus-genome_v1.gtf - gene annotation in GTF format
    * eneotenicus-genome_v1.cds - annotated protein-coding sequences in FASTA format
    * eneotenicus-genome_v1.aa - annotated protein sequences in FASTA format
    * eneotenicus-genome_v1.md - metadata containing detailed information about the dataset
    Návaznost na projekty GA22-28470S
    Institucionální podporaRVO:61388963
    Klíč.slova Embiratermes neotenicus * termite genome * draft assembly * Embiratermes genome
    Lokalizace – místoPraha
    Lokalizace – zeměČeská republika
    LicenceCC BY 4.0 - Uveďte původ. Mezinárodní licence.
    Kontaktní osobaasep@uochb.cas.cz ; Kateřina Šperková, Tel.: 232 002 584 ; Jana Procházková, Tel.: 220 183 418
    DOIhttps://doi.org/10.57680/asep.0640983
    Handle: https://hdl.handle.net/11104/0371307
    Vlastník záznamuÚstav organické chemie a biochemie - ÚOCHB
    SYSNO0640983
    Datum zveřejnění10.11.2025
    Všeobecná poznámkaDetails about the dataset and how it was generated will be available soon in Horacek, N., et al. "Evolutionary origin of terpenoid biosynthesis in termites" (article in preparation).
    Název souboru StaženoVelikostKomentářPřístup
    eneotenicus-genome_v1.zip Přehled souborů40417.1 MBpovolen
Počet záznamů: 1  

Metadata v repozitáři ASEP jsou licencována pod licencí CC0.

  Tyto stránky využívají soubory cookies, které usnadňují jejich prohlížení. Další informace o tom jak používáme cookies.