Počet záznamů: 1  

Draft assembly genomu Embiratermes neotenicus

  1. 1.
    SYSNO ASEP0640983
    Zařazení RIVZáznam nebyl označen do RIV
    NázevDraft assembly genomu Embiratermes neotenicus
    Překlad názvuDraft assembly of the Embiratermes neotenicus genome
    Tvůrce(i) Lukšan, Ondřej (UOCHB-X) ORCID
    Jazyk dok.eng - angličtina
    Klíč. slovaEmbiratermes neotenicus ; termite genome ; draft assembly ; Embiratermes genome
    Obor OECDBiochemistry and molecular biology
    CEPGA22-28470S GA ČR - Grantová agentura ČR
    Institucionální podporaUOCHB-X - RVO:61388963
    DOI https://doi.org/10.57680/asep.0640983
    AnotaceGenomové assembly tvořené 4512 contigy o celkové velikosti 1,38 Gb byl sestaven na základě dlouhých sekvenačních čtení technologie Oxford Nanopore pomocí algoritmu Flye v2.9.4. Dataset sestává z následujících pěti souborů:
    * eneotenicus-genome_v1.fa - genomové assembly ve formátu FASTA
    * eneotenicus-genome_v1.gtf - anotace ve formátu GTF
    * eneotenicus-genome_v1.cds - anotované protein-kódující sekvence ve formátu FASTA
    * eneotenicus-genome_v1.aa - anotované proteinové sekvence ve formátu FASTA
    Překlad anotaceDraft genome consistng of 4512 contigs and ranging 1.38 Gb was assembled from Oxford nanopore long sequence reads using the Flye v2.9.4 algorithm. The dataset includes following five files:
    * eneotenicus-genome_v1.fa - draft genome assembly in FASTA format
    * eneotenicus-genome_v1.gtf - gene annotation in GTF format
    * eneotenicus-genome_v1.cds - annotated protein-coding sequences in FASTA format
    * eneotenicus-genome_v1.aa - annotated protein sequences in FASTA format
    * eneotenicus-genome_v1.md - metadata containing detailed information about the dataset
    PracovištěÚstav organické chemie a biochemie
    Kontaktasep@uochb.cas.cz ; Kateřina Šperková, Tel.: 232 002 584 ; Jana Procházková, Tel.: 220 183 418
    Rok sběru2026
Počet záznamů: 1  

Metadata v repozitáři ASEP jsou licencována pod licencí CC0.

  Tyto stránky využívají soubory cookies, které usnadňují jejich prohlížení. Další informace o tom jak používáme cookies.