Počet záznamů: 1
Transcriptome of barley under three different heavy metal stress reaction
- 1.
SYSNO ASEP 0482959 Druh ASEP J - Článek v odborném periodiku Zařazení RIV J - Článek v odborném periodiku Poddruh J Článek ve WOS Název Transcriptome of barley under three different heavy metal stress reaction Tvůrce(i) Kintlová, Martina (UEB-Q)
Blavet, Nicolas (UEB-Q) RID, ORCID
Cegan, R. (CZ)
Hobza, Roman (UEB-Q) RID, ORCIDCelkový počet autorů 4 Zdroj.dok. GENOMICS DATA - ISSN 2213-5960
Roč. 13, SEP (2017), s. 15-17Poč.str. 3 s. Jazyk dok. eng - angličtina Země vyd. NL - Nizozemsko Klíč. slova plants ; Barley ; RNA-Seq ; Transcriptome ; Heavy metal ; Copper ; Zinc ; Cadmium Vědní obor RIV EB - Genetika a molekulární biologie Obor OECD Plant sciences, botany CEP GBP501/12/G090 GA ČR - Grantová agentura ČR Institucionální podpora UEB-Q - RVO:61389030 UT WOS 000415937000006 EID SCOPUS 85020182457 DOI 10.1016/j.gdata.2017.05.016 Anotace In the present study, we used Illumina sequencing technology (HiSeq 2000) to sequence the transcriptome of barley (Hordeum vulgare L., cv. Morex) under three different heavy metal stress conditions: copper, zinc and cadmium. For each of those metals, the concentration causing a 50% inhibitory effect for root growth (EC50) was determined. We sequenced the total RNA of both roots and shoots from barley with and without heavy metal treatments in three replicates. Raw reads of the transcriptome project have been deposited in NCBI's BioProject accession number PRJNA382490. The obtained transcriptomic data will be useful for further studies focusing on heavy metal tolerance and comparative transcriptome analysis in barley. Pracoviště Ústav experimentální botaniky Kontakt David Klier, knihovna@ueb.cas.cz, Tel.: 220 390 469 Rok sběru 2018
Počet záznamů: 1