Počet záznamů: 1  

Rapid cloning of genes in hexaploid wheat using cultivar-specific long-range chromosome assembly

  1. 1.
    SYSNO ASEP0482335
    Druh ASEPJ - Článek v odborném periodiku
    Zařazení RIVJ - Článek v odborném periodiku
    Poddruh JČlánek ve WOS
    NázevRapid cloning of genes in hexaploid wheat using cultivar-specific long-range chromosome assembly
    Tvůrce(i) Thind, A. K. (CH)
    Wicker, T. (CH)
    Šimková, Hana (UEB-Q) RID, ORCID
    Fossati, D. (CH)
    Moullet, O. (CH)
    Brabant, C. (CH)
    Vrána, Jan (UEB-Q) RID, ORCID
    Doležel, Jaroslav (UEB-Q) RID, ORCID
    Krattinger, S.G. (CH)
    Celkový počet autorů9
    Zdroj.dok.Nature Biotechnology. - : Nature Publishing Group - ISSN 1087-0156
    Roč. 35, č. 8 (2017), s. 793-796
    Poč.str.6 s.
    Jazyk dok.eng - angličtina
    Země vyd.US - Spojené státy americké
    Klíč. slovaadult-plant resistance ; leaf rust ; sequence capture ; genome ; arabidopsis ; virulence ; barley ; canada ; locus ; lr22a
    Vědní obor RIVEB - Genetika a molekulární biologie
    Obor OECDPlant sciences, botany
    CEPLO1204 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy
    Institucionální podporaUEB-Q - RVO:61389030
    UT WOS000407125800028
    DOI10.1038/nbt.3877
    AnotaceCereal crops such as wheat and maize have large repeat-rich genomes that make cloning of individual genes challenging. Moreover, gene order and gene sequences often differ substantially between cultivars of the same crop species1-4. A major bottleneck for gene cloning in cereals is the generation of high-quality sequence information from a cultivar of interest. In order to accelerate gene cloning from any cropping line, we report ` targeted chromosome-based cloning via long-range assembly' (TACCA). TACCA combines lossless genome-complexity reduction via chromosome flow sorting with Chicago long-range linkage5 to assemble complex genomes. We applied TACCA to produce a high-quality (N50 of 9.76 Mb) de novo chromosome assembly of the wheat line CH Campala Lr22a in only 4 months. Using this assembly we cloned the broad-spectrum Lr22a leaf-rust resistance gene, using molecular marker information and ethyl methanesulfonate (EMS) mutants, and found that Lr22a encodes an intracellular immune receptor homologous to the Arabidopsis thaliana RPM1 protein.
    PracovištěÚstav experimentální botaniky
    KontaktDavid Klier, knihovna@ueb.cas.cz, Tel.: 220 390 469
    Rok sběru2018
Počet záznamů: 1  

  Tyto stránky využívají soubory cookies, které usnadňují jejich prohlížení. Další informace o tom jak používáme cookies.