Počet záznamů: 1
Letter to the Editor: Significant mutation enrichment in inverted repeat sites of new SARS-CoV-2 strains
- 1.
SYSNO ASEP 0555649 Druh ASEP J - Článek v odborném periodiku Zařazení RIV J - Článek v odborném periodiku Poddruh J Článek ve WOS Název Letter to the Editor: Significant mutation enrichment in inverted repeat sites of new SARS-CoV-2 strains Tvůrce(i) Bartas, M. (CZ)
Goswami, Pratik (BFU-R)
Lexa, M. (CZ)
Cerven, J. (CZ)
Volna, A. (CZ)
Fojta, Miroslav (BFU-R) RID, ORCID
Brázda, Václav (BFU-R) RID, ORCID
Pečinka, P. (CZ)Celkový počet autorů 8 Číslo článku bbab129 Zdroj.dok. Briefings in Bioinformatics. - : Oxford University Press - ISSN 1467-5463
Roč. 22, č. 5 (2021)Poč.str. 2 s. Forma vydání Online - E Jazyk dok. eng - angličtina Země vyd. GB - Velká Británie Klíč. slova SARS-CoV-2 ; mutations ; inverted repeats Obor OECD Biochemistry and molecular biology CEP GA18-15548S GA ČR - Grantová agentura ČR EF15_003/0000477 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy Způsob publikování Open access Institucionální podpora BFU-R - RVO:68081707 UT WOS 000709461800149 EID SCOPUS 85116173294 DOI 10.1093/bib/bbab129 Anotace In a recently published paper, we have found that SARS-CoV-2 hot-spot mutations are significantly associated with inverted repeat loci and CG dinucleotides. However, fast-spreading strains with new mutations (so-called mink farm mutations, England mutations and Japan mutations) have been recently described. We used the new datasets to check the positioning of mutation sites in genomes of the new SARS-CoV-2 strains. Using an open-access Palindrome analyzer tool, we found mutations in these new strains to be significantly enriched in inverted repeat loci. Pracoviště Biofyzikální ústav Kontakt Jana Poláková, polakova@ibp.cz, Tel.: 541 517 244 Rok sběru 2022 Elektronická adresa https://academic.oup.com/bib/article/22/5/bbab129/6219140
Počet záznamů: 1