Počet záznamů: 1
Continuous Activity Assay for HDAC11 Enabling Reevaluation of HDAC Inhibitors
- 1.
SYSNO ASEP 0519605 Druh ASEP J - Článek v odborném periodiku Zařazení RIV J - Článek v odborném periodiku Poddruh J Článek ve WOS Název Continuous Activity Assay for HDAC11 Enabling Reevaluation of HDAC Inhibitors Tvůrce(i) Kutil, Zsófia (BTO-N) RID, ORCID
Mikesova, Jana (BTO-N)
Zessin, M. (DE)
Meleshin, M. (DE)
Nováková, Zora (BTO-N) ORCID, RID
Alquicer, Glenda (BTO-N)
Kozikowski, A. (US)
Sippl, W. (DE)
Bařinka, Cyril (BTO-N) RID, ORCID
Schutkowski, M. (DE)Celkový počet autorů 10 Zdroj.dok. ACS Omega. - : American Chemical Society - ISSN 2470-1343
Roč. 4, č. 22 (2019), s. 19895-19904Poč.str. 10 s. Jazyk dok. eng - angličtina Země vyd. US - Spojené státy americké Klíč. slova histone deacetylase inhibitors ; sir2 family ; POSTTRANSLATIONAL MODIFICATIONS Vědní obor RIV EB - Genetika a molekulární biologie Obor OECD Biochemistry and molecular biology CEP GA15-19640S GA ČR - Grantová agentura ČR ED1.1.00/02.0109 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy Způsob publikování Open access Institucionální podpora BTO-N - RVO:86652036 UT WOS 000499133200042 DOI https://doi.org/10.1021/acsomega.9b02808 Anotace Histone deacetylase 11 (HDAC11) preferentially removes fatty acid residues from lysine side chains in a peptide or protein environment. Here, we report the development and validation of a continuous fluorescence-based activity assay using an internally quenched TNF alpha-derived peptide derivative as a substrate. The threonine residue in the +1 position was replaced by the quencher amino acid 3'-nitro-L-tyrosine and the fatty acyl moiety substituted by 2-aminobenzoylated 11-aminoundecanoic acid. The resulting peptide substrate enables fluorescence-based direct and continuous readout of HDAC11-mediated amide bond cleavage fully compatible with high-throughput screening formats. The Z'-factor is higher than 0.85 for the 15 mu M substrate concentration, and the signal-to-noise ratio exceeds 150 for 384-well plates. In the absence of NAD(+), this substrate is specific for HDAC 11. Reevaluation of inhibitory data using our novel assay revealed limited potency and selectivity of known HDAC inhibitors, including Elevenostat, a putative HDAC11-specific inhibitor. Pracoviště Biotechnologický ústav Kontakt Monika Kopřivová, Monika.Koprivova@ibt.cas.cz, Tel.: 325 873 700 Rok sběru 2020 Elektronická adresa https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acsomega.9b02808
Počet záznamů: 1