Počet záznamů: 1
Identification of Protein Targets of Bioactive Small Molecules Using Randomly Photomodified Probes
- 1.
SYSNO ASEP 0499970 Druh ASEP J - Článek v odborném periodiku Zařazení RIV J - Článek v odborném periodiku Poddruh J Článek ve WOS Název Identification of Protein Targets of Bioactive Small Molecules Using Randomly Photomodified Probes Tvůrce(i) Šimon, Petr (UOCHB-X) ORCID
Knedlík, Tomáš (UOCHB-X) RID, ORCID
Blažková, Kristýna (UOCHB-X) ORCID, RID
Dvořáková, Petra (UOCHB-X)
Březinová, Anna (UOCHB-X)
Kostka, Libor (UMCH-V) RID, ORCID
Šubr, Vladimír (UMCH-V) RID, ORCID
Konvalinka, Jan (UOCHB-X) RID, ORCID
Šácha, Pavel (UOCHB-X) RID, ORCIDZdroj.dok. ACS Chemical Biology. - : American Chemical Society - ISSN 1554-8929
Roč. 13, č. 12 (2018), s. 3333-3342Poč.str. 10 s. Jazyk dok. eng - angličtina Země vyd. US - Spojené státy americké Klíč. slova glutamate carboxypeptidase II ; inhibitor ; design Vědní obor RIV CE - Biochemie Obor OECD Biochemistry and molecular biology Vědní obor RIV – spolupráce Ústav makromolekulární chemie - Makromolekulární chemie CEP GA16-02938S GA ČR - Grantová agentura ČR LO1302 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy NV15-31379A GA MZd - Ministerstvo zdravotnictví Institucionální podpora UOCHB-X - RVO:61388963 ; UMCH-V - RVO:61389013 UT WOS 000454568000015 EID SCOPUS 85058505988 DOI 10.1021/acschembio.8b00791 Anotace Identifying protein targets of bioactive small molecules often requires complex, lengthy development of affinity probes. We present a method for stochastic modification of small molecules of interest with a photo-activatable phenyldiazirine linker. The resulting isomeric mixture is conjugated to a hydrophilic copolymer decorated with biotin and a fluorophore. We validated this approach using known inhibitors of several medicinally relevant enzymes. At least a portion of the stochastic derivatives retained their binding to the target, enabling target visualization, isolation, and identification. Moreover, the mix of stochastic probes could be separated into fractions and tested for binding affinity. The structure of the active probe could be determined and the probe resynthesized to improve binding efficiency. Our approach an thus enable rapid target isolation, identification, and visualization, while providing information required for subsequent synthesis of an optimized probe. Pracoviště Ústav organické chemie a biochemie Kontakt asep@uochb.cas.cz ; Kateřina Šperková, Tel.: 232 002 584 ; Jana Procházková, Tel.: 220 183 418 Rok sběru 2019
Počet záznamů: 1