Počet záznamů: 1
Next-Generation Sequencing Reveals the Impact of Repetitive DNA Across Phylogenetically Closely Related Genomes of Orobanchaceae
- 1.
SYSNO ASEP 0381629 Druh ASEP J - Článek v odborném periodiku Zařazení RIV J - Článek v odborném periodiku Poddruh J Článek ve WOS Název Next-Generation Sequencing Reveals the Impact of Repetitive DNA Across Phylogenetically Closely Related Genomes of Orobanchaceae Tvůrce(i) Piednoël, M. (DE)
Aberer, A.J. (DE)
Schneeweiss, G. M. (AT)
Macas, Jiří (BC-A) RID, ORCID, SAI
Novák, Petr (BC-A) RID, ORCID
Gundlach, H. (DE)
Temsch, E.M. (DE)
Renner, S.S. (DE)Celkový počet autorů 8 Zdroj.dok. Molecular Biology and Evolution. - : Oxford University Press - ISSN 0737-4038
Roč. 29, č. 11 (2012), s. 3601-3611Poč.str. 11 s. Forma vydání Tištěná - P Jazyk dok. eng - angličtina Země vyd. US - Spojené státy americké Klíč. slova next-generation sequencing ; polyploidy ; genome size ; Ty3/Gypsy ; transposable elements Vědní obor RIV EB - Genetika a molekulární biologie Institucionální podpora BC-A - RVO:60077344 CEZ AV0Z50510513 - UMBR-M, BC-A (2005-2011) UT WOS 000310167700030 DOI 10.1093/molbev/mss168 Anotace We used next-generation sequencing to characterize the genomes of nine species of Orobanchaceae of known phylogenetic relationships, different life forms, and including a polyploid species. The study species are the autotrophic, nonparasitic Lindenbergia philippensis, the hemiparasitic Schwalbea americana, and seven nonphotosynthetic parasitic species of Orobanche (Orobanche crenata, Orobanche cumana, Orobanche gracilis (tetraploid), and Orobanche pancicii) and Phelipanche (Phelipanche lavandulacea, Phelipanche purpurea, and Phelipanche ramosa). Ty3/Gypsy elements comprise 1.93%-28.34% of the nine genomes and Ty1/Copia elements comprise 8.09%-22.83%. When compared with L. philippensis and S. americana, the nonphotosynthetic species contain higher proportions of repetitive DNA sequences, perhaps reflecting relaxed selection on genome size in parasitic organisms. Pracoviště Biologické centrum (od r. 2006) Kontakt Dana Hypšová, eje@eje.cz, Tel.: 387 775 214 Rok sběru 2013
Počet záznamů: 1