Already Two Water Molecules Change Planar H-bonded Structure of the Adenine...Thymine Base Pair to the Stacked Ones: a Molecular Dynamics Simulation Study
1.
SYSNO ASEP
0180978
Druh ASEP
J - Článek v odborném periodiku
Zařazení RIV
J - Článek v odborném periodiku
Poddruh J
Ostatní články
Název
Already Two Water Molecules Change Planar H-bonded Structure of the Adenine...Thymine Base Pair to the Stacked Ones: a Molecular Dynamics Simulation Study
Tvůrce(i)
Kabeláč, Martin (UFCH-W) Ryjáček, Filip (UFCH-W) Hobza, Pavel (UFCH-W)
Zdroj.dok.
Physical Chemistry Chemical Physics. - : Royal Society of Chemistry
- ISSN 1463-9076
Roč. 2, č. 21 (2000), s. 4906-4909
Jazyk dok.
eng - angličtina
Země vyd.
GB - Velká Británie
Vědní obor RIV
CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
CEP
LN00A032 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy
CEZ
AV0Z4040901 - UFCH-W
A54/98:Z4-040-9-ii
Anotace
The dynamical structure of adenine...thymime nucleic acid base pair exposed to as small number of water molecules (from 1 to 216) was determined using molecular dynamics simulations with Cornell et al. force field.The gradual increase of hydration number results in transition from planar base pair structures to nonplanar ones, and already for two water molecules the population of stacked structures is higher than that of planar structures.
