Structure, Energetics, Vibrational Frequencies and Charge Transfer of Base Pairs, Nucleoside Pairs, Nucleotide Pairs and B-DNA Pairs of Trinucleotides: ab initio HF/MINI-1 and Empirical Force Field Study

Name: Structure, Energetics, Vibrational Frequencies and Charge Transfer of Base Pairs, Nucleoside Pairs, Nucleotide Pairs and B-DNA Pairs of Trinucleotides: ab initio HF/MINI-1 and Empirical Force Field Study
Availability: OutOfStock

Kabeláč, Martin; Kratochvíl, Martin; Šponer, Jiří; Hobza, Pavel

Počet záznamů: 1

Structure, Energetics, Vibrational Frequencies and Charge Transfer of Base Pairs, Nucleoside Pairs, Nucleotide Pairs and B-DNA Pairs of Trinucleotides: ab initio HF/MINI-1 and Empirical Force Field Study

1.

SYSNO ASEP	0180909
Druh ASEP	J - Článek v odborném periodiku
Zařazení RIV	J - Článek v odborném periodiku
Poddruh J	Ostatní články
Název	Structure, Energetics, Vibrational Frequencies and Charge Transfer of Base Pairs, Nucleoside Pairs, Nucleotide Pairs and B-DNA Pairs of Trinucleotides: ab initio HF/MINI-1 and Empirical Force Field Study
Tvůrce(i)	Kabeláč, Martin (UFCH-W) Kratochvíl, Martin (UFCH-W) Šponer, Jiří (UFCH-W) Hobza, Pavel (UFCH-W)
Zdroj.dok.	Journal of Biomolecular Structure & Dynamics. - : Taylor & Francis - ISSN 0739-1102 Roč. 17, č. 6 (2000), s. 1077-1086
Jazyk dok.	eng - angličtina
Země vyd.	US - Spojené státy americké
Vědní obor RIV	CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
CEP	GA203/97/0029 GA ČR - Grantová agentura ČR
CEZ	AV0Z4040901 - UFCH-W
	A54/98:Z4-040-9-ii
Anotace	Geometries, interaction energies and vibrational frequencies of base pairs, nucleoside pairs and nucleotide pairs were studied by ab initio method and empirical AMBER 4.1 force field.A good agreement was found between HF/MINI-1 and AMBER results.Stabilization energies of clusters are lowered when passing from base pairs to nucleoside, nucleotide pairs and to pairs of trinucleotides. The lowest vibrations of base pairs and nucleoside pairs correspond to intermolecular motions of bases.
Pracoviště	Ústav fyzikální chemie J.Heyrovského
Kontakt	Michaela Knapová, michaela.knapova@jh-inst.cas.cz, Tel.: 266 053 196
Rok sběru	2001

Počet záznamů: 1