Počet záznamů: 1
A polyphasic approach to assess the cyanobacterial diversity of summer samples from Czech reservoirs
- 1.
SYSNO ASEP 0029804 Druh ASEP J - Článek v odborném periodiku Zařazení RIV J - Článek v odborném periodiku Poddruh J Ostatní články Název A polyphasic approach to assess the cyanobacterial diversity of summer samples from Czech reservoirs Překlad názvu Polyfázický přístup k odhadu diversity sinic u letních vzorků z českých přehrad Tvůrce(i) Boutte, Ch. (BE)
Komárková, Jaroslava (HBU-Z) RID
Grubisic, S. (BE)
Znachor, Petr (HBU-Z)
Bataille, A. (BE)
Zapomělová, E. (CZ)
Gullukaya, A. (BE)
Jezberová, Jitka (HBU-Z)
Wilmotte, A. (BE)Zdroj.dok. Archiv für Hydrobiologie. Algological Studies - ISSN 0342-1120
-, č. 117 (2005), s. 177-195Poč.str. 19 s. Akce Symposium of the International Association for Cyanophyte Research /16./ Datum konání 30.08.2004-03.09.2004 Místo konání Luxembourg Země LU - Lucembursko Typ akce WRD Jazyk dok. eng - angličtina Země vyd. DE - Německo Klíč. slova DGGE ; 16S rRNA ; cyanobacteria ; eutrophic reservoirs Vědní obor RIV EE - Mikrobiologie, virologie CEP IBS6017004 GA AV ČR - Akademie věd CEZ AV0Z60170517 - HBU-Z, BC-A (2005-2011) Anotace We used a polyphasic approach combining data from microscopic assessment of fresh biomass and from clone libraries and DGGE fingerprints based on 16S rRNA gene sequences to investigate the cyanobacterial diversity of Czech reservoirs during the summer in 2001 and 2002. Total of 15 genera were identified using the microscopic analysis in 38 samples analysed. We recovered 113 DGGE band sequences from the same samples. Identification of the major populations by the microscopic enumeration and the molecular results were generally congruent (for 32 samples out of 38). Differences concerned the presence of minor populations of minute genera. Aphanothece, Merismopedia, Pseudanabaena, Romeria, Snowella and Synechococcus. These differences can be explained by biases specific to each method (competitive amplification, difficulty to obtain sequences from DGGE bands, problems of microscopic observation of the small-sized genera). Pracoviště Hydrobiologický ústav (do r. 2005) Kontakt Václava Lavičková, lavickova@hbu.cas.cz, Tel.: 387 775 889 Rok sběru 2006
Počet záznamů: 1