Počet záznamů: 1
Intronic Determinants Coordinate Charme lncRNA Nuclear Activity through the Interaction with MATR3 and PTBP1
- 1.
SYSNO ASEP 0538143 Druh ASEP J - Článek v odborném periodiku Zařazení RIV J - Článek v odborném periodiku Poddruh J Článek ve WOS Název Intronic Determinants Coordinate Charme lncRNA Nuclear Activity through the Interaction with MATR3 and PTBP1 Tvůrce(i) Desideri, F. (IT)
Cipriano, A. (IT)
Petrezselyova, Silvia (UMG-J)
Buonaiuto, G. (IT)
Santini, T. (IT)
Kašpárek, Petr (UMG-J)
Procházka, Jan (UMG-J) ORCID
Janson, G. (IT)
Paiardini, A. (IT)
Calicchio, A. (IT)
Colantoni, A. (IT)
Sedláček, Radislav (UMG-J) RID
Bozzoni, I. (IT)
Ballarino, M. (IT)Celkový počet autorů 14 Číslo článku 108548 Zdroj.dok. Cell Reports. - : Cell Press - ISSN 2211-1247
Roč. 33, č. 12 (2020)Poč.str. 21 s. Forma vydání Online - E Jazyk dok. eng - angličtina Země vyd. US - Spojené státy americké Klíč. slova tract binding-protein ; noncoding rna ; gene-expression ; regulatory networks ; splicing repressor ; phase-separation ; distal myopathy ; x-chromosome ; localization ; sequences Vědní obor RIV EB - Genetika a molekulární biologie Obor OECD Developmental biology CEP LM2015040 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy LM2018126 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ED2.1.00/19.0395 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ED1.1.00/02.0109 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy EF16_013/0001789 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy Způsob publikování Open access Institucionální podpora UMG-J - RVO:68378050 UT WOS 000601399100024 DOI 10.1016/j.celrep.2020.108548 Anotace Chromatin architect of muscle expression (Charme) is a muscle-restricted long noncoding RNA (lncRNA) that plays an important role in myogenesis. Earlier evidence indicates that the nuclear Charme isoform, named pCharme, acts on the chromatin by assisting the formation of chromatin domains where myogenic transcription occurs. By combining RNA antisense purification (RAP) with mass spectrometry and loss-of-function analyses, we have now identified the proteins that assist these chromatin activities. These proteins-which include a sub-set of splicing regulators, principally PTBP1 and the multifunctional RNA/DNA binding protein MATR3-bind to sequences located within the alternatively spliced intron-1 to form nuclear aggregates. Consistent with the functional importance of pCharme interactome in vivo, a targeted deletion of the intron-1 by a CRISPR-Cas9 approach in mouse causes the release of pCharme from the chromatin and results in cardiac defects similar to what was observed upon knockout of the full-length transcript. Pracoviště Ústav molekulární genetiky Kontakt Nikol Škňouřilová, nikol.sknourilova@img.cas.cz, Tel.: 241 063 217 Rok sběru 2021 Elektronická adresa https://www.cell.com/cell-reports/fulltext/S2211-1247(20)31537-0?_returnURL=https%3A%2F%2Flinkinghub.elsevier.com%2Fretrieve%2Fpii%2FS2211124720315370%3Fshowall%3Dtrue
Počet záznamů: 1