Počet záznamů: 1
Study of deoxyribonucleic acid-ligand interactions by partial filling affinity capillary electrophoresis
- 1.
SYSNO ASEP 0430010 Druh ASEP J - Článek v odborném periodiku Zařazení RIV J - Článek v odborném periodiku Poddruh J Článek ve WOS Název Study of deoxyribonucleic acid-ligand interactions by partial filling affinity capillary electrophoresis Tvůrce(i) Růžička, Martin (UOCHB-X) RID
Čížková, Martina (UOCHB-X) RID
Jirásek, Michael (UOCHB-X) RID
Teplý, Filip (UOCHB-X) RID, ORCID
Koval, Dušan (UOCHB-X) RID, ORCID
Kašička, Václav (UOCHB-X) RID, ORCIDCelkový počet autorů 6 Zdroj.dok. Journal of Chromatography A. - : Elsevier - ISSN 0021-9673
Roč. 1349, Jul (2014), s. 116-121Poč.str. 6 s. Akce ITP 2013. International Symposium on Electro- and Liquid Phase- Separation Techniques /20./ Datum konání 06.10.2013-09.10.2013 Místo konání Puerto de la Cruz Země ES - Španělsko Typ akce WRD Jazyk dok. eng - angličtina Země vyd. NL - Nizozemsko Klíč. slova affinity capillary electrophoresis ; stability constant ; DNA ; ethidium bromide ; oligophenylene derivatives ; partial filling Vědní obor RIV CB - Analytická chemie, separace CEP GAP206/12/0453 GA ČR - Grantová agentura ČR GA13-17224S GA ČR - Grantová agentura ČR GA13-32974S GA ČR - Grantová agentura ČR GA13-19213S GA ČR - Grantová agentura ČR Institucionální podpora UOCHB-X - RVO:61388963 UT WOS 000337851000014 EID SCOPUS 84901593808 DOI 10.1016/j.chroma.2014.04.061 Anotace In this work, a new partial filling affinity capillary electrophoresis (PF-ACE) method has been developed and applied to investigation of non-covalent molecular interactions between double stranded DNA oligonucleotide (Dickerson dodecamer) and classical DNA intercalator ligand-ethidiumbromide (EtBr) or oligophenylene derivatives-based potential new type of DNA ligands. Binding constants of DNA-ligand complexes were determined from the dependence of migration time changes of DNA oligomer (applied as analyte) on the length of ligand zones introduced beforehand as plugs of various lengths (0-75 mm with 12.5 mm step) in hydroxypropylcellulose coated fused silica capillary of 50/375 mu m I.D./O.D. and 400/300 mm total/effective length. PF-ACE experiments were performed in two background electrolytes, Tris-borate, pH 8.0, ionic strength 14.3 mM (BGE1), and sodium phosphate, pH 7.5, ionic strength 133 mM (BGE2). Binding constants of DNA-EtBr complex (ca 15300 L/mol in the BGE1 and 4200 L/mol in the BGE2) were found to be significantly higher than those of DNA complexes with oligophenylene derivatives (ca 2200-3600 L/mol in the BGE1 and 1600-2300 L/mol in the BGE2). Pracoviště Ústav organické chemie a biochemie Kontakt asep@uochb.cas.cz ; Kateřina Šperková, Tel.: 232 002 584 ; Jana Procházková, Tel.: 220 183 418 Rok sběru 2015
Počet záznamů: 1