Počet záznamů: 1
Unraveling the phospholipid identity of the gene expression compartments by single molecule localization microscopy
- 1.
SYSNO ASEP 0555844 Druh ASEP O - Ostatní výsledky Zařazení RIV O - Ostatní Název Unraveling the phospholipid identity of the gene expression compartments by single molecule localization microscopy Tvůrce(i) Hoboth, Peter (UMG-J) ORCID
Sztacho, Martin (UMG-J) ORCID
Šebesta, O. (CZ)
Hozák, Pavel (UMG-J) RID, ORCIDRok vydání 2021 Jazyk dok. eng - angličtina Země vyd. CZ - Česká republika Klíč. slova single-molecule localization microscopy ; nuclear phosphatidylinositol phosphates ; nucleoplasm ; nuclear speckles ; RNA polymerase II transcription Vědní obor RIV EB - Genetika a molekulární biologie Obor OECD Cell biology CEP GA19-05608S GA ČR - Grantová agentura ČR GA18-19714S GA ČR - Grantová agentura ČR LTC19048 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy LTC20024 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ED1.1.00/02.0109 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy LM2018129 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy EF16_013/0001775 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy Výzkumná infrastruktura Czech-BioImaging II - 90129 - Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i. Institucionální podpora UMG-J - RVO:68378050 Anotace Current models of gene expression acknowledge protein clustering and formation of transcriptional condensates as a driving force of gene expression. These models are mostly based on single-molecule localization microscopy (SMLM) which provided an unprecedented insight into the sub-nuclear organization of proteins and nucleic acids. However, the roles of nuclear lipids in the establishment of the functional nuclear architecture, apart from the nuclear envelope, has been neglected. Nevertheless, accumulating evidence suggests the involvement of nuclear lipids and particularly of phosphatidylinositol phosphates (PIPs) in gene expression. We used quantitative SMLM for the evaluation of the nuclear PIP distribution while preserving the context of nuclear architecture. We showed phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate (PI(4,5)P2), phosphatidylinositol 3,4-bisphosphate (PI(3,4)P2) and phosphatidylinositol 4-monophosphate (PI(4)P) within nuclear speckles and in the nucleoplasmic foci. Moreover, we found PI(4,5)P2 and PI(3,4)P2 in the close proximity with the subset of RNA polymerase II (RNAPII) foci either in the nucleoplasm or nuclear speckles. We continue to uncover the PIP fingerprints in the subsequent stages of RNAPII transcription. Our efforts aim at elucidating the roles of nuclear PIPs in the compartmentalization of gene expression. Pracoviště Ústav molekulární genetiky Kontakt Nikol Škňouřilová, nikol.sknourilova@img.cas.cz, Tel.: 241 063 217 Rok sběru 2022
Počet záznamů: 1