R-qPCR-SYBR Kit, prototyp univerzální soupravy pro kvantifikaci RNA ligační metodou

0534591 - ÚMG 2021 RIV CZ cze L - Prototyp, funkční vzorek
Tůmová, Magda - Dráber, M. - Dráber, Petr
R-qPCR-SYBR Kit, prototyp univerzální soupravy pro kvantifikaci RNA ligační metodou.
[R-qPCR-SYBR Kit, a prototype of a universal kit for RNA quantification by the ligation method
.]
Interní kód: FV20479-1 SYBR ; 2020
Technické parametry: R-qPCR-SYBR Kit je univerzální souprava která je optimalizovaná z hlediska složení a způsobu užití na průkaz RNA ligační metodou. V současné době se jedná o možnosti komerčního využití této univerzální soupravy u příjemce dotace, firmy Top-Bio, s.r.o., IČO 64578895, Průmyslová 596, 252 50 Vestec, Tel. 603476934
Ekonomické parametry: Uvedením soupravy na trh může dojít k zvýšení objemu výroby a zisku výrobců souprav pro stanovení RNA.
Grant CEP: GA MPO FV20479
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: Gene expression * RNA quantification * polymerase chain reaction * SYBR green I * ligation of DNA probes * quantitative PCR
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology

R-qPCR-SYBR Kit je univerzální souprava pro kvantifikaci RNA s využitím ligace DNA sond specifických pro studovanou RNA. Množství ligovaných DNA sond je určováno pomocí real-time PCR (qPCR). DNA amplikony generované v qPCR jsou kvantifikovány pomocí interkalačního barviva SYBR Green I. Souprava obsahuje všechny komponenty nezbytné pro hybridizaci DNA sond s analyzovanou RNA, ligaci DNA sond vázaných na RNA pomocí ligázy a následnou amplifikaci ligované DNA v qPCR. Komponenty soupravy jsou ve třech zkumavkách obsahujících (1) Hybridizační a ligační pufr, (2) ligázu ve skladovacím pufru a (3) qPCR master mix se SYBR Green I. Komponenty soupravy umožní kvantifikaci vybrané RNA ve 100 vzorcích. Komponenty soupravy mají roční expiraci při skladování v -20 ± 5oC. Součástí soupravy je podrobný návod pro provedení R-qPCR, včetně metodiky pro návrhování specifických DNA sond pro kvantifikaci RNA.

The R-qPCR-SYBR Kit is a universal kit for RNA quantification using ligation of DNA probes specific for the RNA being studied. The amount of ligated DNA probes is determined by real-time PCR (qPCR). DNA amplicons generated in qPCR are quantified using SYBR Green I intercalation dye. The kit contains all components necessary for hybridization of DNA probes to the analyzed RNA, ligation of RNA-bound DNA probes with ligase, and subsequent amplification of ligated DNA in qPCR. The kit components are in three tubes containing (1) Hybridization and ligation buffer, (2) ligase in storage buffer, and (3) qPCR master mix with SYBR Green I. The kit components allow quantification of selected RNA in 100 samples. The components of the kit have an annual expiration date when stored at -20 ± 5oC. The kit includes detailed instructions for performing R-qPCR, including a methodology for designing specific DNA probes for RNA quantification.
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0312761