Počet záznamů: 1
Srovnání střevní mikrobioty myši panonské (Mus spicilegus) a myši domácí (Mus musculus)
- 1.
SYSNO ASEP 0471355 Druh ASEP A - Abstrakt Zařazení RIV Záznam nebyl označen do RIV Zařazení RIV Není vybrán druh dokumentu Název Srovnání střevní mikrobioty myši panonské (Mus spicilegus) a myši domácí (Mus musculus) Tvůrce(i) Bendová, B. (CZ)
Kreisinger, Jakub (UBO-W) RID, SAI, ORCID
Ďureje, Ľudovít (UBO-W) RID, SAI, SAI
Piálek, Jaroslav (UBO-W) RID, ORCID, SAICelkový počet autorů 4 Zdroj.dok. Zoologické dny Brno 2017: sborník abstraktů z konference 9.-10. února 2017. - Brno : Ústav biologie obratlovců AV ČR, 2017 / Bryja J. ; Horsák M. ; Horsáková V. ; Řehák Z. ; Zukal J. - ISBN 978-80-87189-21-4
S. 27Poč.str. 1 s. Akce Zoologické dny Datum konání 09.02.2017 - 10.02.2017 Místo konání Brno Země CZ - Česká republika Typ akce EUR Jazyk dok. cze - čeština Země vyd. CZ - Česká republika Vědní obor RIV EG - Zoologie Institucionální podpora UBO-W - RVO:68081766 Anotace Myš domácí představuje důležitý model v biomedicínském výzkumu, který je však nejčastěji prováděn pouze na laboratorně chovaných jedincích. Ve střední Evropě je myš domácí synantropně žijícím druhem a jako hostitel potencionálně patogenních organismů hraje důležitou roli ve zdraví člověka. Ukazuje se, že laboratorně chovaní jedinci mají odlišné složení gastrointestinální mikrobioty než jedinci z volně žijících populací. V současnosti však neexistují data, které by u myší popisovala efekt synantropie na složení mikrobioty. Proto jsme se rozhodli prozkoumat gastrointestinální mikrobiotu u ferálně žijící myši panonské (Mus spicilegus) a porovnat ji s mikrobiotou u blízce příbuzné a synantropně žijící myši domácí (Mus musculus) ze stejné geografické oblasti.
K analýze byly použity vzorky od 8 jedinců myši panonské a 4 jedinců myši domácí, které byly získány ze dvou vzájemně sousedících lokalit na východním Slovensku, Drienovec a Čečejovce, v roce 2015. Od každého zvířete byly analyzovány vzorky z více částí střeva (intestinum, caecum a colon) za využití 16s RNA amplikonové sekvenování na platformě Illumina Miseq.
Z hlediska složení bakteriálního společenstva trávicího traktu jsme pozorovali větší odlišnosti mezi jednotlivými částmi střeva, než mezi hostitelskými druhy. Avšak naše analýzy odhalily signifikantní rozdíly i mezi jednotlivými druhy po kontrole na variabilitu uvnitř střeva. Ty se projevily nejvíce při testech zohledňujících přítomnost či nepřítomnost jednotlivých bakteriálních taxonomických jednotek. Naopak menší mezidruhové rozdíly se ukázaly při testech hodnotících proporční zastoupení bakterií. U obou hostitelských druhů nejvíce dominovaly kmeny Firmicutes (rody Lactobacillus a Oscillospira), Proteobacteria (rod Helicobacter), Bacteroidetes (rody Bacteroides a Odoribacter), Tenericutes (rod Mycoplasma) a Deferribacteres (rod Mucispirillum).
Pracoviště Ústav biologie obratlovců Kontakt Hana Slabáková, slabakova@ivb.cz, Tel.: 543 422 524 Rok sběru 2017
Počet záznamů: 1