Dokážeme rozpoznať nový druh len na základe genetiky?

0454060 - ÚBO 2016 CZ slo A - Abstrakt
Aghová, Tatiana - Šumbera, R. - Bryja, Josef
Dokážeme rozpoznať nový druh len na základe genetiky?
Zoologické dny Brno 2015: sborník abstraktů z konference 12.-13. února 2015. Brno: Ústav biologie obratlovců AV ČR, 2015 - (Bryja, J.; Řehák, Z.; Zukal, J.). s. 26. ISBN 978-80-87189-18-4.
[Zoologické dny. 12.02.2015-13.02.2015, Brno]
Grant CEP: GA ČR GAP506/10/0983
Institucionální podpora: RVO:68081766
Kód oboru RIV: EG - Zoologie

Molekulárno-genetické metódy priniesli revolúciu pri popisovaní nových druhov. Napriek tomuto rozvoju, určiť nový druh nie je jednoduché. Rozlíšiť, či nová genetická línia už odpovedá úrovni druhu, je komplikované. Riešením je buď analýza typového materiálu (pre genetické analýzy často nedostupný) alebo kombinácia genetickej a morfologickej analýzy. V
niektorých prípadoch však genetické a morfologické dáta môžu byť rozporuplné (napr. kryptické druhy). Ďalším spôsobom je tzv. "species delimitation" (vytýčenie druhu). Dnes už bolo vyvinutých niekoľko metód s rozdielnymi modelmi a parametrami (BPP, BFD, GMYC, PTP), ktoré sú viac či menej vhodné pre delimitáciu druhu na základe genetického datasetu.
My sme si pre testovanie "species delimitation" zvolili modelový organizmus z Východnej Afriky – hlodavce rodu Gerbilliscus (Muridae). Na základe multilokusovej fylogenetickej analýzy sme identifikovali 11 genetických línií, ktoré podľa platnej taxonómie mali zodpovedať
štyrom druhom. Pomocou metódy Baysiean phylogeny and phylogeography (BPP) sme testovali reálny počet druhov. Vo Východnej Afrike sme určili 6 druhov, z toho dva nové druhy (G. cf. bayeri a G. sp. n. "Babile"). Identifikácia druhov pomocou genetiky nemá za cieľ potlačiť klasickú taxonómiu do úzadia, hoci je časovo náročná a vyžaduje špecialistov. Jej cieľom je slúžiť ako silný nástroj na správnu interpretáciu genetických dát.
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0254755