Počet záznamů: 1
Calculation of clusters of hydrated amino-acid conformers
- 1.
SYSNO ASEP 0451604 Druh ASEP L4 - Software Zařazení RIV R - Software Název Calculation of clusters of hydrated amino-acid conformers Tvůrce(i) Biedermannová, Lada (BTO-N) RID, ORCID Rok vydání 2014 Int.kód cluster.sh Technické parametry BASH script, licence GPL 3 Ekonomické parametry typový projekt Název vlastníka Biotechnologický ústav AV ČR, v. v. i. IČ vlastníka 86652036 Využ. jiným subjektem P - Využití výsledku jiným subjektem je v některých případech možné bez nabytí licence Požad. na licenč. popl. N - Poskytovatel licence nepožaduje licenční poplatek Číselná identifikace 57/2015 Jazyk dok. eng - angličtina Země vlastníka CZ - Česká republika Klíč. slova protein hydration ; structural biology ; X-ray crystallography, data mining ; conformational clustering Vědní obor RIV BO - Biofyzika Vědní obor RIV – spolupráce Biofyzika CEP GPP205/12/P729 GA ČR - Grantová agentura ČR ED1.1.00/02.0109 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy Institucionální podpora BTO-N - RVO:86652036 CEZ AV0Z50520701 - BTO-N (2007-2013) Anotace Program downoads specified set of structures from the Protein Data Bank (PDB), performs structure quality check, adds neighboring crystallographic cells, extracts water molecules in the vicinity of the selected protein chain, analyzes protein-water contacts, water-amino-acid-residue distance distributions and residue SASA distributions, and classifies and clusters residue conformations based on secondary structure and rotameric state.
Pracoviště Biotechnologický ústav Kontakt Monika Kopřivová, Monika.Koprivova@ibt.cas.cz, Tel.: 325 873 700 Rok sběru 2016 Elektronická adresa http://www.dnatco.org/atlas/cluster/
Počet záznamů: 1