LinkMRC - user software for optimalized composition of consecutive stacks of images from confocal microscope
1.
SYSNO ASEP
0308637
Druh ASEP
L - Prototyp, funkční vzorek
Zařazení RIV
G - Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek)
Název
LinkMRC - user software for optimalized composition of consecutive stacks of images from confocal microscope
Překlad názvu
LinkMRC - program pro optimalizované skládání následně snímaných serií obrazů z konfokálního mikroskopu
Tvůrce(i)
Karen, Petr (FGU-C)
Rok vydání
2008
Int.kód
LinkMRC
Lokalizace výsledku
FGU-C
Technické parametry
Borland C++ / MS Windows - standalone program
Ekonomické parametry
Open source
Název vlastníka
Fyziologický ústav AV ČR
IČ vlastníka
67985823
Kat.výsl.dle nákl.
A - Vyčerpaná část nákladů <= 5 mil. Kč
Využ. jiným subjektem
N - Využití výsledku jiným subjektem je možné bez nabytí licence
Požad. na licenč. popl.
N - Poskytovatel licence nepožaduje licenční poplatek
Jazyk dok.
eng - angličtina
Země vlastníka
CZ - Česká republika
Klíč. slova
image processing ; confocal microscopy
Vědní obor RIV
JC - Počítačový hardware a software
CEP
GA304/05/0153 GA ČR - Grantová agentura ČR
LC06063 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy
CEZ
AV0Z50110509 - FGU-C (2005-2011)
Anotace
LinkMRC is a program for composing two series of consecutive thick optical sections captured by a Bio-Rad confocal microscope. Input is represented by two files in native format and output by one file containing series of confocal images composed from the two input series, one above the other and aligned by rotation and translation. The alignment of consecutive sections is refined by automatic algorithms based either on minimalization of the sum of absolute valued differences between the consecutive images from two sections, or on maximalization of normalized correlation coefficient or mutual information function between the consecutive parts of sections
