Počet záznamů: 1  

Fast satellite DNA evolution in Nothobranchius annual killifishes

  1. 1.
    SYSNO ASEP0580412
    Druh ASEPJ - Článek v odborném periodiku
    Zařazení RIVJ - Článek v odborném periodiku
    Poddruh JČlánek ve WOS
    NázevFast satellite DNA evolution in Nothobranchius annual killifishes
    Tvůrce(i) Voleníková, Anna (UZFG-Y)
    Lukšíková, Karolína (UZFG-Y)
    Mora, P. (ES)
    Pavlica, Tomáš (UZFG-Y)
    Altmanová, Marie (UZFG-Y) ORCID
    Štundlová, Jana (UZFG-Y)
    Pelikánová, Šárka (UZFG-Y)
    Simanovsky, S. A. (RU)
    Jankásek, Marek (UZFG-Y)
    Reichard, Martin (UBO-W) RID, ORCID, SAI, SAI
    Nguyen, Petr (UZFG-Y)
    Sember, Alexandr (UZFG-Y) RID, ORCID
    Číslo článku33
    Zdroj.dok.Chromosome Research. - : Springer - ISSN 0967-3849
    Roč. 31, č. 4 (2023)
    Poč.str.19 s.
    Forma vydáníOnline - E
    Jazyk dok.eng - angličtina
    Země vyd.DE - Německo
    Klíč. slovacentromere drive ; constitutive heterochromatin ; repeatExplorer ; repetitive sequences ; satDNA
    Vědní obor RIVEB - Genetika a molekulární biologie
    Obor OECDGenetics and heredity (medical genetics to be 3)
    CEPGJ19-22346Y GA ČR - Grantová agentura ČR
    LM2018131 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy
    Výzkumná infrastrukturaELIXIR-CZ II - 90131 - Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
    e-INFRA CZ - 90140 - CESNET, zájmové sdružení právnických osob
    Způsob publikováníOpen access
    Institucionální podporaUZFG-Y - RVO:67985904 ; UBO-W - RVO:68081766
    UT WOS001110171900001
    EID SCOPUS85177476874
    DOI10.1007/s10577-023-09742-8
    AnotaceSatellite DNA (satDNA) is a rapidly evolving class of tandem repeats, with some monomers being involved in centromere organization and function. To identify repeats associated with (peri)centromeric regions, we investigated satDNA across Southern and Coastal clades of African annual killifishes of the genus Nothobranchius. Molecular cytogenetic and bioinformatic analyses revealed that two previously identified satellites, designated here as NkadSat01-77 and NfurSat01-348, are associated with (peri)centromeres only in one lineage of the Southern clade. NfurSat01-348 was, however, additionally detected outside centromeres in three members of the Coastal clade. We also identified a novel satDNA, NrubSat01-48, associated with (peri)centromeres in N. foerschi, N. guentheri, and N. rubripinnis. Our findings revealed fast turnover of satDNA associated with (peri)centromeres and different trends in their evolution in two clades of the genus Nothobranchius.
    PracovištěÚstav živočišné fyziologie a genetiky
    KontaktJana Zásmětová, knihovna@iapg.cas.cz, Tel.: 315 639 554
    Rok sběru2024
    Elektronická adresahttps://link.springer.com/article/10.1007/s10577-023-09742-8
Počet záznamů: 1  

  Tyto stránky využívají soubory cookies, které usnadňují jejich prohlížení. Další informace o tom jak používáme cookies.