Počet záznamů: 1
Nanoscale mapping of nuclear phosphatidylinositol phosphate landscape by dual-color dSTORM
- 1.
SYSNO ASEP 0541498 Druh ASEP J - Článek v odborném periodiku Zařazení RIV J - Článek v odborném periodiku Poddruh J Článek ve WOS Název Nanoscale mapping of nuclear phosphatidylinositol phosphate landscape by dual-color dSTORM Tvůrce(i) Hoboth, Peter (UMG-J) ORCID
Sztacho, Martin (UMG-J) ORCID
Šebesta, O. (CZ)
Schätz, M. (CZ)
Castano, Enrique (UMG-J)
Hozák, Pavel (UMG-J) RID, ORCIDČíslo článku 158890 Zdroj.dok. Biochimica Et Biophysica Acta-Molecular and Cell Biology of Lipids. - : Elsevier - ISSN 1388-1981
Roč. 1866, č. 5 (2021)Poč.str. 16 s. Forma vydání Online - E Jazyk dok. eng - angličtina Země vyd. GB - Velká Británie Klíč. slova Cell nucleus ; Nuclear speckles ; Nucleolus ; Phosphatidylinositol phosphates ; RNA polymerase II ; STORM Vědní obor RIV EA - Morfologické obory a cytologie Obor OECD Cell biology CEP ED1.1.00/02.0109 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy LM2018129 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy EF16_013/0001775 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy GA19-05608S GA ČR - Grantová agentura ČR GA18-19714S GA ČR - Grantová agentura ČR LTC19048 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy LTC20024 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy Způsob publikování Omezený přístup Institucionální podpora UMG-J - RVO:68378050 UT WOS 000636044300002 DOI 10.1016/j.bbalip.2021.158890 Anotace Current models of gene expression, which are based on single-molecule localization microscopy, acknowledge protein clustering and the formation of transcriptional condensates as a driving force of gene expression. However, these models largely omit the role of nuclear lipids and amongst them nuclear phosphatidylinositol phosphates (PIPs) in particular. Moreover, the precise distribution of nuclear PIPs in the functional sub-nuclear domains remains elusive. The direct stochastic optical reconstruction microscopy (dSTORM) provides an unprecedented resolution in biological imaging. Therefore, its use for imaging in the densely crowded cell nucleus is desired but also challenging. Here we present a dual-color dSTORM imaging and image analysis of nuclear PI(4,5)P2, PI(3,4)P2 and PI(4)P distribution while preserving the context of nuclear architecture. In the nucleoplasm, PI(4,5)P2 and PI(3,4)P2 co-pattern in close proximity with the subset of RNA polymerase II foci. PI(4,5)P2 is surrounded by fibrillarin in the nucleoli and all three PIPs are dispersed within the matrix formed by the nuclear speckle protein SON. PI(4,5)P2 is the most abundant nuclear PIP, while PI(4)P is a precursor for the biosynthesis of PI(4,5)P2 and PI(3,4)P2. Therefore, our data are relevant for the understanding the roles of nuclear PIPs and provide further evidence for the model in which nuclear PIPs represent a localization signal for the formation of lipo-ribonucleoprotein hubs in the nucleus. The discussed experimental pipeline is applicable for further functional studies on the role of other nuclear PIPs in the regulation of gene expression and beyond. Pracoviště Ústav molekulární genetiky Kontakt Nikol Škňouřilová, nikol.sknourilova@img.cas.cz, Tel.: 241 063 217 Rok sběru 2021 Elektronická adresa https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1388198121000160?via%3Dihub
Počet záznamů: 1