GlueMRC - user software for optimalized merging of mosaic-layout stacks of images from confocal microscope
1.
SYSNO ASEP
0308640
Druh ASEP
L - Prototyp, funkční vzorek
Zařazení RIV
G - Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek)
Název
GlueMRC - user software for optimalized merging of mosaic-layout stacks of images from confocal microscope
Překlad názvu
GlueMRC - program pro optimalizované skládání mozaikově snímaných serií obrazů z konfokálního mikroskopu
Tvůrce(i)
Karen, Petr (FGU-C)
Rok vydání
2008
Int.kód
GlueMRC
Lokalizace výsledku
FGU-C
Technické parametry
Borland C++ / MS Windows - standalone program
Ekonomické parametry
Open source
Název vlastníka
Fyziologický ústav AV ČR
IČ vlastníka
67985823
Kat.výsl.dle nákl.
A - Vyčerpaná část nákladů <= 5 mil. Kč
Využ. jiným subjektem
N - Využití výsledku jiným subjektem je možné bez nabytí licence
Požad. na licenč. popl.
N - Poskytovatel licence nepožaduje licenční poplatek
Jazyk dok.
eng - angličtina
Země vlastníka
CZ - Česká republika
Klíč. slova
image processing ; confocal microscopy
Vědní obor RIV
JC - Počítačový hardware a software
CEP
GA304/05/0153 GA ČR - Grantová agentura ČR
LC06063 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy
CEZ
AV0Z50110509 - FGU-C (2005-2011)
Anotace
GlueMRC is a program for composing two overlapping series of optical sections captured by a Bio-Rad confocal microscope. Input is represented by two microscope native-format files and output by one file containing series of confocal images composed from the two input overlapping series. The image alignment is refined by automatic algorithms based either on minimalization of the sum of absolute valued differences between the overlapping parts of the images, or on maximalization of normalized correlation coefficient or mutual information function between the image overlaps